结论：劳动局（现一般称为人力资源和社会保障局）是否会管因承包方个人施工不当破坏原材料且未整改好，发包方扣除工钱的问题，需分情况讨论，主要取决于双方的法律关系以及纠纷的具体性质。
一、若双方为劳动关系
法律关系分析：
- 如果承包方与发包方之间构成劳动关系，即承包方是发包方的员工，那么发包方扣除工钱的行为就属于工资支付问题，这属于劳动局的管辖范围。
法律依据与处理：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位（发包方）应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者（承包方）及时足额支付劳动报酬。
- 如果发包方因承包方施工不当而扣除工钱，且这种扣除没有合理的依据或未按照劳动合同约定进行，那么承包方可以向劳动局投诉，劳动局会依法进行调查处理，包括要求发包方支付被扣除的工钱，并可能对发包方进行处罚。
建议：
- 在此情况下，承包方应首先与发包方进行沟通，明确扣除工钱的原因和依据。
- 如果沟通无果，承包方可以向劳动局投诉，并提供相关证据（如劳动合同、工资条、工作记录等）以支持其主张。
二、若双方为承揽关系或劳务关系
法律关系分析：
- 如果承包方与发包方之间构成承揽关系或劳务关系，即承包方是独立承担民事责任的个体或单位，那么发包方扣除工钱的行为就属于合同纠纷或民事纠纷，这通常不属于劳动局的直接管辖范围。
法律依据与处理：
- 在这种情况下，双方应依据《中华人民共和国民法典》中关于承揽合同或劳务合同的相关规定来处理纠纷。
- 如果发包方因承包方施工不当而扣除工钱，且这种扣除有合理的依据（如合同中明确约定了因施工不当导致的损失由承包方承担），那么承包方可能需要通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来解决纠纷。
建议：
- 在此情况下，承包方应首先仔细审查与发包方签订的合同，明确双方的权利和义务。
- 如果认为发包方的扣除行为不合理或违反了合同约定，承包方可以与发包方进行协商，尝试达成和解。
- 如果协商无果，承包方可以考虑通过调解、仲裁或诉讼等方式来维护自己的合法权益。
进一步思考：无论双方构成何种法律关系，解决纠纷的关键在于明确双方的权利和义务，以及提供充分的证据来支持自己的主张。因此，在发生纠纷时，双方都应保持冷静，积极收集证据，并寻求专业的法律帮助以更好地维护自己的权益。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。