针对您入职国企后二级建造师证书仍在原单位的问题，这确实是一个需要妥善处理的情况。根据相关规定和实际操作流程，以下是我为您提供的详细解答：

首先，您需要明确的是，根据《注册建造师执业管理办法》(建市]〔2008〕48号)第十九条的规定，注册建造师在申请注销注册时，必须提供与原聘用企业解除劳动关系的有效证明材料。这是注销注册的前提条件。

针对您目前的情况，如果原单位一直不配合注销二级建造师证书，您可以采取以下步骤来维护自己的权益：

1. 与原单位沟通：

   • 尝试与原单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确表达您希望注销二级建造师证书的意愿，并了解他们不配合的具体原因。
   • 如果沟通无果，或者原单位提出不合理的要求，您可以考虑采取更进一步的措施。

2. 向劳动仲裁部门或法院申诉：

   • 如果原单位不配合出具解聘、离职证明，您可以向当地的劳动仲裁部门或法院提出申诉，要求解除与原单位的劳动关系。
   • 劳动仲裁部门或法院在受理您的申诉后，会进行调查和调解，如果调解无果，将作出裁决或判决，出具解除劳动关系的证明材料。

3. 申请注销注册：

   • 在您与原单位解除劳动关系后，您就可以准备相关材料申请注销二级建造师证书了。
   • 您需要提交的材料包括：与原单位解除劳动关系的有效证明材料（如劳动仲裁裁决书、法院判决书等）、申请报告（注明注册经历、与企业纠纷情况，并在报告落款处亲笔签字按手印）等。

4. 向省注册中心注册科进行申诉：

   • 如果您与原单位解除劳动关系后，企业仍不予配合办理建造师相关手续，您可以将上述材料提交到省注册中心注册科进行申诉。
   • 省注册中心注册科在受理您的申诉后，会进行审核和调查，并根据实际情况作出处理决定。

另外，关于省注册中心注册科的具体地址和联系电话，由于不同地区的可能有所不同，我建议您在提交申诉前，先通过当地住建厅或相关部门的官方网站查询最新的地址和联系电话，以确保您能够顺利提交申诉材料。

最后，我想强调的是，处理这类问题需要耐心和细心。在整个过程中，您需要保持与原单位、劳动仲裁部门或法院、省注册中心注册科等各方的沟通，确保信息的准确传递和问题的及时解决。希望这些建议能够对您有所帮助。