结论：领导让您承担五十多万项目中的一万多问题且不发提成是否合法，需分情况讨论，一般情况下不合法，但若您存在故意或重大过失且合同或公司制度有明确规定，可能合法。以下为详细分析：
一、一般情况下不合法
责任承担方面：
- 在项目执行过程中，若出现问题并非完全由您个人原因导致，而是由于多种因素（如团队协作、公司决策、市场环境等）共同作用的结果，那么要求您个人承担全部或大部分责任是不合理的。
- 根据一般的法律原则和职场惯例，责任应当根据过错程度进行分担。如果领导在没有充分证据证明您存在故意或重大过失的情况下，单方面要求您承担责任，这可能构成对您的不公平对待。
提成发放方面：
- 提成是员工因完成特定任务或达成特定业绩而获得的额外报酬。如果公司或领导在您已经完成相应任务或达成业绩的情况下，无正当理由拒绝发放提成，这违反了劳动合同或公司制度中关于提成发放的规定。
- 您可以查阅与公司的劳动合同或相关规章制度，确认其中是否有关于提成发放的具体条款。如果合同或制度中有明确规定，且您符合发放提成的条件，那么公司或领导无权拒绝发放。
二、可能合法的情况
您存在故意或重大过失：
- 如果项目出现问题确实是由于您的故意或重大过失导致的，且公司或领导能够提供充分证据证明这一点，那么根据劳动合同或公司制度中的相关规定，您可能需要承担相应的责任。
- 在这种情况下，如果合同或制度中明确规定了因员工故意或重大过失导致项目损失时，公司有权扣除部分或全部提成作为赔偿，那么领导的做法可能是合法的。
合同或公司制度有明确规定：
- 如果您与公司签订的劳动合同或公司制定的规章制度中明确规定了在项目出现问题时员工需要承担的责任范围以及提成发放的条件和方式，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么领导的做法可能是合法的。
- 在这种情况下，您需要仔细审查合同或制度中的相关条款，确认自己是否确实违反了规定以及需要承担的责任范围。
三、建议与行动
与公司沟通：
- 首先，您可以尝试与领导或公司人力资源部门进行沟通，了解他们要求您承担责任和拒绝发放提成的具体原因和依据。
- 在沟通过程中，您可以提供自己的证据和理由来反驳不合理的指责和要求。
查阅合同和制度：
- 仔细查阅您与公司签订的劳动合同以及公司制定的相关规章制度，确认其中关于责任承担和提成发放的具体规定。
寻求法律援助：
- 如果沟通无果且您认为自己的权益受到了侵害，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），了解自己的法律权益和可能的维权途径。
保留证据：
- 在整个过程中，务必保留好相关证据（如工作记录、沟通记录、合同和制度文本等），以便在需要时提供证明。
如果您有任何进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。