针对您提出的问题“合同给员工但是员工以合同瑕疵为由没签，需要赔偿二倍工资吗”，结论前置如下：
- 若用人单位能证明已尽到合理催告义务，且员工无正当理由拒绝签订，用人单位无需支付二倍工资。
- 若用人单位无法证明已尽到合理催告义务，或员工不签合同后用人单位继续用工，则可能需要支付二倍工资。
详细分析
一、用人单位无需支付二倍工资的情形
已尽到合理催告义务：
- 用人单位在用工之日起一个月内，应向员工发出书面催告，明确告知其签订劳动合同的重要性、相关法律后果，并给予一定的合理期限让其签订。
- 若员工在催告后仍拒绝签订，用人单位应及时书面通知终止劳动关系，并支付员工实际工作时间的劳动报酬。
- 在此情况下，用人单位无需支付二倍工资，因为其已尽到合理催告义务，且员工无正当理由拒绝签订合同。
员工无正当理由拒绝签订：
- 员工以合同瑕疵为由拒绝签订，但若该瑕疵并不构成合同无效或可撤销的法定情形（如欺诈、胁迫、显失公平等），则员工的拒绝理由可能不被法律认可。
- 若员工无正当理由拒绝签订合同，且用人单位已尽到合理催告义务，则用人单位无需支付二倍工资。
二、用人单位需要支付二倍工资的情形
未尽到合理催告义务：
- 若用人单位未能提供证据证明已书面通知员工签订劳动合同，或未在用工之日起一个月内进行催告，则可能被视为未尽到合理催告义务。
- 在此情况下，即使员工以合同瑕疵为由拒绝签订，用人单位也可能因违反《劳动合同法》关于签订书面劳动合同的强制性规定，而需向员工每月支付二倍的工资。
员工不签合同后继续用工：
- 若员工拒绝签订合同后，用人单位未及时终止劳动关系，而是继续用工，则可能被视为默认接受了员工不签订合同的事实。
- 在此情况下，用人单位需从用工之日起满一个月的次日起，向员工每月支付二倍的工资，直至补订书面劳动合同的前一日或用工满一年（此时视为已订立无固定期限劳动合同）。
三、合同瑕疵的认定与处理
- 合同瑕疵的认定：合同瑕疵通常指合同内容存在不明确、不完整或违反法律法规强制性规定等情形。若员工以合同瑕疵为由拒绝签订，应首先评估该瑕疵是否构成合同无效或可撤销的法定情形。
- 合同瑕疵的处理：若合同确实存在瑕疵，用人单位应及时与员工协商修改合同内容，以消除瑕疵。若员工仍拒绝签订，且用人单位已尽到合理催告义务，则用人单位可依法终止劳动关系。
法律建议
- 用人单位应完善合同签订流程：确保在用工之日起一个月内与员工签订书面劳动合同，并保留好相关证据（如书面催告通知、员工签字确认的合同等）。
- 员工应积极配合签订合同：若员工对合同内容有异议，应及时与用人单位沟通协商，而非直接拒绝签订。若员工无正当理由拒绝签订合同，可能面临被用人单位终止劳动关系且无法获得经济补偿的风险。
- 双方应依法维护自身权益：若发生争议，双方应首先通过友好协商解决；协商无果的，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
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