民营企业在实际操作中，如果安排劳动者加班，是应当支付加班费的，这是劳动者的合法权益，也是民营企业的法律义务。以下从不同角度为您详细分析：
法律依据与标准
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，用人单位在特定情形下需支付高于正常工作时间工资的工资报酬，具体标准如下：
延长工作时间：安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的百分之一百五十（1.5倍）的工资报酬。例如，若员工正常工作日每小时工资为20元，加班3小时，则加班费为20×1.5×3=90元。
休息日工作且无补休：休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百（2倍）的工资报酬。例如，员工日工资为200元，在休息日加班一天且无补休，则加班费为200×2=400元。
法定节假日工作：法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的百分之三百（3倍）的工资报酬。例如，员工日工资为200元，在法定节假日加班一天，则加班费为200×3=600元。
民营企业加班费支付情况
在实际操作中，民营企业是否支付加班费，往往取决于企业的管理规范程度、对劳动法律法规的遵守情况以及与劳动者的约定。一些管理规范、注重员工权益的民营企业，会严格按照法律规定支付加班费。然而，也有一些民营企业可能存在不支付或不足额支付加班费的情况，这侵犯了劳动者的合法权益。
劳动者权益保护
如果民营企业未依法支付加班费，劳动者有权采取以下措施维护自己的合法权益：
与企业协商：首先尝试与企业进行友好协商，要求支付应得的加班费。
向劳动监察部门投诉：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，由其对企业的违法行为进行调查和处理。劳动监察部门有权责令企业支付拖欠的加班费，并可能对企业进行罚款等处罚。
申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，劳动者还可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，通过法律途径追讨加班费并维护自己的合法权益。劳动仲裁机构或法院将依法审理案件，并作出公正裁决。
特殊情况说明
虽然法律规定了加班费的支付标准和条件，但在实际操作中，也可能存在一些特殊情况。例如，某些民营企业可能通过与劳动者签订特殊协议或约定，对加班费的支付进行个性化安排。然而，这种安排必须不违反法律法规的强制性规定，否则将被视为无效。
总结来说，民营企业在实际操作中如果安排劳动者加班，是应当支付加班费的。劳动者应了解自己的权益，并在权益受到侵害时采取适当的措施进行维权。如果您在民营企业工作并遇到了加班费支付问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。