商家因健康证过期直接关门不做的做法存在问题，可能涉及行政处罚及经营中断的合法性风险，具体分析如下：

1. 健康证过期的法律后果
   根据《食品安全法》《公共场所卫生管理条例》等规定，从业人员健康证过期属于违法行为，监管部门可责令改正、警告或罚款（通常为500-5000元，具体金额因地区和情节而异）。但直接关门停业并非法定处罚方式，商家无权自行决定以关门替代接受处罚。

2. 关门停业的合法性风险

   • 若商家因健康证过期主动停业，需注意：
     
     • 未履行整改义务：监管部门可能认定商家逃避监管，加重处罚（如吊销许可证）；
       
     • 合同违约风险：若租赁合同或加盟协议中约定“因自身原因停业需承担违约责任”，商家可能面临赔偿；
       
     • 消费者权益损害：若停业导致预付费消费者无法消费，可能引发集体投诉或诉讼。
       
   • 若商家因被监管部门强制停业（如查封场所），则需配合整改后申请复业，擅自关门可能被认定为拒不执行行政决定。

3. 建议处理方式

   • 立即整改：尽快组织员工办理新健康证，并向监管部门提交整改报告；
     
   • 沟通协商：主动联系监管部门说明情况，争取从轻处理（如减免罚款）；
     
   • 法律救济：若对处罚有异议，可申请行政复议或提起行政诉讼，但需在法定期限内提出。

总结：健康证过期应通过补办证件、接受处罚等方式解决，直接关门停业可能扩大法律风险。若商家已因此面临具体处罚或纠纷，可进一步向我咨询具体应对方案。