上班以上厕所为由扣工资，一般是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

根据《劳动法》及相关规定，劳动者享有休息休假的权利，这自然包括了在工作期间合理的上厕所时间。上厕所是劳动者正常的生理需求，是维持其正常工作状态所必需的，因此，因上厕所而短暂离开工作岗位，不应被视为违反劳动纪律或旷工，用人单位以此为由扣减工资缺乏法律依据。

实际情况角度

1. 合理时间内上厕所：如果劳动者在合理的时间内上厕所，且没有影响正常的工作秩序和效率，那么用人单位无权扣减工资。这里的“合理时间”通常指的是根据一般人的生理需求和实际情况，能够完成上厕所这一行为所需的时间。

2. 长时间或频繁上厕所：如果劳动者长时间或频繁上厕所，且明显超出了正常生理需求的范围，影响了正常的工作秩序和效率，那么用人单位可能会根据内部规章制度对劳动者进行一定的管理或处罚。但这种处罚应当是合理且合法的，不能直接扣减工资。如果用人单位因此扣减工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

特殊情况角度

在某些特殊行业或岗位，如需要连续作业的生产线、需要高度集中注意力的监控岗位等，劳动者上厕所的时间可能会受到一定的限制。但即便如此，用人单位也应当为劳动者提供合理的上厕所时间和条件，不能以此为由扣减工资。如果用人单位确实因为工作需要限制了劳动者上厕所的时间，那么应当通过合理的排班、调休等方式来保障劳动者的合法权益。

建议与后果

• 建议：如果劳动者遇到用人单位以上厕所为由扣减工资的情况，首先应当与用人单位进行沟通协商，明确自己的权益和用人单位的义务。如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。

• 后果：如果用人单位违法扣减工资，除了需要补发工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，这种行为也可能影响用人单位的声誉和形象，对用人单位的长期发展不利。

综上所述，上班以上厕所为由扣工资一般是不合法的。如果你遇到了类似的情况，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的法律建议。