结论：在一个公司工作了20年，病假两个星期是否扣钱，这主要取决于公司的规章制度、劳动合同的约定以及相关法律法规的规定。以下从多个角度进行分析：
一、公司规章制度与劳动合同约定
公司规章制度：
- 许多公司会制定自己的病假管理制度，明确病假期间的工资支付标准。如果公司规章制度中规定病假期间不扣工资或按一定比例支付工资，那么员工在病假两个星期时，公司应按照该规定执行。
- 如果公司规章制度中未明确规定病假期间的工资支付标准，或者规定与法律法规相冲突，那么应依据法律法规来确定。
劳动合同约定：
- 劳动合同是员工与公司之间约定双方权利和义务的法律文件。如果劳动合同中明确约定了病假期间的工资支付标准，那么公司应按照劳动合同的约定执行。
- 如果劳动合同中未约定或约定不明确，同样应依据法律法规来确定。
二、相关法律法规规定
《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》：
- 该规定明确了企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息时，用人单位不得解除劳动合同的时限，即医疗期。医疗期的长度根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限来确定，最长可达24个月。
- 在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费，其标准由用人单位按照不低于当地最低工资标准的80%支付。但具体支付标准可能因地区而异，需参照当地的具体规定。
地方性法规或规章：
- 不同地区可能根据当地实际情况制定了关于病假工资支付的地方性法规或规章。这些规定可能对病假期间的工资支付标准、支付方式等作出更具体的规定。
- 因此，在判断病假两个星期是否扣钱时，还需考虑当地的具体规定。
三、实际操作建议
查阅公司规章制度和劳动合同：
- 首先，员工应查阅公司的规章制度和劳动合同，了解其中关于病假期间工资支付的规定。
咨询公司人力资源部门：
- 如果对公司规章制度或劳动合同中的规定有疑问，员工可以咨询公司的人力资源部门，以获取更准确的解释和指导。
了解当地法律法规：
- 员工还可以了解当地关于病假工资支付的具体法律法规，以确保自己的权益得到保障。
保留相关证据：
- 在病假期间，员工应保留好相关的医疗证明和请假记录等证据，以备不时之需。
举例说明：假设某公司规章制度中规定，员工病假期间工资按正常工资的80%支付，且该规定不违反当地法律法规。那么，在该员工病假两个星期时，公司应按照其正常工资的80%支付病假工资。如果公司规章制度或劳动合同中未明确规定，且当地法律法规也未作出具体规定，那么公司应参照不低于当地最低工资标准的80%来支付病假工资。
后续行动建议：如果您对病假期间的工资支付标准仍有疑问，或者认为公司未按照规定支付病假工资，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律建议。