结论前置：一年劳动合同约定三个月转正是否合法，关键在于“转正”的具体含义。若“转正”指的是试用期结束，则此约定违法；若“转正”仅为企业内部考核或评级变化，与试用期无关，则此约定本身不违法。
详细分析：
若“转正”指试用期结束：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第十九条的规定，劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月。因此，如果一年期的劳动合同中约定三个月试用期，即三个月后“转正”，这一约定违反了法律对试用期长度的明确限制，是违法的。
- 法律后果：违法的试用期约定无效，劳动者有权要求用人单位按照法定试用期执行，或向劳动监察部门投诉、通过劳动仲裁维护自身权益。
若“转正”仅为企业内部考核或评级变化：
- 如果“三个月转正”并非指试用期结束，而是指企业内部对于员工从入职到经考核认定达到正式员工工作标准的一个过渡期限，且这个过程中约定的试用期没有超过法律规定的上限（如两个月），那么这种约定本身并不违法。它更多地是企业内部管理的一种做法，只要双方同意并明确在合同中，就是合法的。
- 实际操作建议：即使“转正”仅为企业内部考核或评级变化，也建议用人单位在劳动合同中明确区分“试用期”和“转正考核期”，避免使用模糊表述导致争议。同时，应确保试用期时长、考核标准及转正程序等关键条款的明确约定，以保障双方权益。
劳动者权益保护：
- 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于试用期和转正的约定，确保自己的权益不受侵害。
- 如对合同条款有疑问或觉得不对劲，应及时咨询专业律师或相关机构，以获取准确的法律意见。
- 若发现用人单位存在违法的试用期约定或其他侵害劳动者权益的行为，劳动者有权向劳动监察部门投诉或通过劳动仲裁来维护自身权益。
用人单位合规建议：
- 用人单位在制定劳动合同和规章制度时，应严格遵守法律法规的规定，确保试用期和转正机制的合法性。
- 应妥善保存试用期考核结果、员工签字确认的考核文件等证据材料，以备在发生争议时作为证明转正合法性的关键依据。
综上所述，一年劳动合同约定三个月转正的合法性取决于“转正”的具体含义。劳动者和用人单位在签订和履行劳动合同时，应秉持诚信原则，共同维护劳动合同的严肃性和权威性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。