针对您提出的“员工工作三个月后生病怎么办”的问题，以下是一份详细且深入的处理指南：
一、及时就医与病假申请流程
员工行动：
- 一旦发现身体不适，员工应立即前往正规医疗机构就诊，病情严重时应拨打急救电话并通知单位。
- 就诊时，务必妥善保存所有医疗凭证，包括病历、诊断证明、检查报告以及医疗费用发票等，这些将是后续请假和报销的重要依据。
单位协助：
- 单位在得知员工生病后，应提供必要的协助，如帮助联系急救车辆、协调工作交接等。
- 员工需凭医院出具的病假证明向单位申请病假，单位应根据病情和医生建议合理确定病假时长，并按照规章制度批准病假申请，同时做好考勤记录。
二、病假工资与物质补助政策
- 根据相关法律法规，员工在规定的医疗期内，单位应支付不低于当地最低工资标准80%的病假工资或疾病救济费。
- 除了法定病假工资外，单位还可以考虑给予员工一定的物质补助，如慰问品或慰问金，以减轻其经济负担，并继续为其缴纳社保。对于绩效考核工资、岗位补贴和奖金等，单位可根据实际情况酌情发放。
三、劳动合同保障措施
- 在病假期间且劳动合同未到期之前，除非员工存在重大过错，否则单位不得以生病为由单方面解除劳动合同。这是保障员工合法权益的重要法律条款。
四、治疗费用处理方式
- 员工患病期间的治疗、就诊、住院费用，应按照医疗保险程序执行。社保支付的部分，个人和单位均无需承担；个人负担的部分，由员工自行承担。单位可以协助员工了解医保报销流程，提供必要的帮助。
五、工伤与职业病认定流程
工伤认定：
- 如员工在工作时间和工作岗位突发疾病死亡，或在48小时之内经抢救无效死亡，单位应立即报告当地劳动保障行政部门，并在规定时间内申请工伤认定。
- 经认定为工伤后，员工可享受相应的工伤保险待遇，包括丧葬补助金、一次性工亡补助金等。若单位未依法缴纳工伤保险费，则需承担这些费用。
职业病认定：
- 如员工怀疑自己患有职业病，应及时到指定医疗卫生机构进行职业病诊断，并提供相关资料。对诊断结果有异议的，可申请鉴定。
- 单位应保障职业病病人依法享受国家规定的职业病待遇，包括治疗、康复、定期检查等，并妥善安置不适宜继续从事原工作的职业病病人。
六、医疗期满后的处理方案
- 若员工在规定的医疗期满后仍无法从事原工作，也不能从事单位另行安排的工作，单位在提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同，但需支付相应的经济补偿金。这是法律规定的单位在员工医疗期满后的合法处理方式。
七、其他人性化建议
- 单位可根据实际生产经营情况安排其他员工代替生病员工的岗位，以确保业务正常运转。同时，单位领导或有关部门可安排人员进行看望和慰问，体现人文关怀，增强员工的归属感和忠诚度。
综上所述，处理员工工作三个月后生病的情况时，单位和员工都应遵循相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。同时，单位也应通过人性化的管理措施，营造一个关爱员工、和谐共进的工作环境。