在合同期内，如果员工生病了，企业应当依据相关法律法规，全面且细致地处理这一问题，以保障员工的合法权益，同时维护企业的正常运转。以下是一些具体的建议和措施：

一、病假申请与医疗期确定

1. 病假申请：员工生病后，应尽快向企业提交医院出具的诊断证明或病假建议书，以申请病假。企业应及时审核这些材料，并批准合理的病假申请。

2. 医疗期确定：根据员工的实际工作年限和在本企业的工作年限，确定其应享受的医疗期。医疗期的长短有明确规定，例如，实际工作年限十年以下的，本单位工作年限五年以下的为三个月，五年以上的为六个月；实际工作年限十年以上的，医疗期则更长。

二、病假期间的权益保障

1. 工资支付：在医疗期内，企业应按照相关规定支付员工病假工资或疾病救济费。这些费用可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。具体标准需遵守当地劳动部门的规定。

2. 社保缴纳：企业必须继续为患病员工缴纳社会保险，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，以确保员工在病假期间仍能享受相关待遇。

3. 福利待遇：除非企业规章制度有特别规定，否则员工在病假期间的其他福利待遇，如住房补贴、交通补贴等，也应正常发放。绩效考核工资、岗位补贴和奖金等则可根据实际情况酌情发放。

三、人文关怀与物质支持

1. 人文关怀：企业应本着人道主义原则，对生病员工进行看望和慰问，表达关心和关怀，这有助于增强员工的归属感和忠诚度。

2. 物质支持：在条件允许的情况下，企业可以给予生病员工一定的物质补助，如慰问品或慰问金，以减轻其经济负担。

四、工作安排与调整

1. 避免不利工作：在员工病假期间，企业应避免安排其从事对身体恢复不利的工作，以确保员工能够安心养病。

2. 医疗期满后的工作安排：医疗期满后，如果员工不能从事原工作，企业应与其协商调整工作岗位，确保新岗位与员工的身体状况、技能水平相适应，且劳动条件不降低。

五、劳动合同的处理

1. 医疗期内：在医疗期内，企业一般不得随意解除劳动合同。除非员工存在严重违反规章制度等法定过错情形，否则单方面解除劳动合同属于违法行为，企业需承担相应的法律责任，包括支付赔偿金等。

2. 医疗期满后：如果医疗期满后员工仍不能从事原工作或企业另行安排的工作，企业可以提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并支付相应的经济补偿金。经济补偿金的标准按员工在本企业的工作年限计算，每满一年支付一个月工资。

六、完善内部制度与沟通

1. 制定病假管理制度：企业应制定明确的病假管理制度，包括病假的申请流程、审批权限、证明材料要求以及病假期间的待遇等事项，以确保制度的合法性和合理性。

2. 加强沟通与培训：企业应与员工就病假政策进行充分沟通，解答疑问，消除误解。同时，对管理人员进行相关培训，提高其处理病假事务的能力和水平。

综上所述，企业在处理合同期内员工生病的问题时，应严格遵守法律法规，全面保障员工的合法权益，同时采取灵活措施维护员工的身心健康和企业的正常运转。通过合理的病假管理、人文关怀和物质支持，以及妥善的工作安排和劳动合同处理，企业可以构建一个和谐、稳定的劳动关系环境。