结论：上一天休一天的情况下，请假一天是否扣两天钱，这并非一个固定的规则，而是取决于公司的具体规章制度以及您与公司之间的劳动合同约定。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度角度：
- 许多公司会制定自己的考勤和请假制度，这些制度中会明确规定请假的计算方式和扣款标准。
- 如果公司的规章制度中明确规定，在“上一天休一天”的轮班制度下，请假一天将扣除两天的工资或视为旷工两天，那么公司按照此规定执行是合法的，但前提是该规章制度已经过民主程序制定，且已向员工公示或告知。
- 如果公司的规章制度中没有此类明确规定，或者规定与实际情况不符，那么公司不能单方面决定扣除两天的工资。
劳动合同角度：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。
- 如果劳动合同中明确约定了请假制度，包括请假期间的工资支付方式，那么双方应按照劳动合同的约定执行。
- 如果劳动合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么应参照公司的规章制度执行。如果规章制度也不明确，那么应依据相关法律法规和公平原则进行协商处理。
法律法规角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，劳动者享有休息休假的权利，用人单位应依法保障劳动者的休息休假权益。
- 在请假期间，用人单位一般不应无故扣除劳动者的工资，除非劳动者违反了公司的规章制度或劳动合同中的约定。
- 如果公司无故扣除劳动者两天的工资，且没有合理的依据，那么劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
建议：
- 首先，查看您的劳动合同和公司的规章制度，了解其中关于请假和工资支付的具体规定。
- 如果发现公司存在不合理的扣款行为，可以先与公司进行协商，寻求合理的解决方案。
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
示例说明：
假设您与公司签订的劳动合同中明确规定，在“上一天休一天”的轮班制度下，请假一天将扣除一天的工资。那么，公司扣除您一天的工资是合法的。但如果劳动合同或公司规章制度中没有此类规定，公司却扣除了您两天的工资，那么您就有权提出异议并寻求法律帮助。
总之，在处理此类问题时，建议您先了解清楚公司的规章制度和劳动合同中的相关约定，再根据实际情况采取相应的措施。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。