暴雨迟到扣奖金是否合法，需根据具体情况综合判断。若暴雨构成不可抗力或符合用人单位特殊规定，则扣奖金不合法；若未采取合理措施且超出合理范围，则扣奖金可能合法。以下是对此问题的详细分析：
一、不合法的情况
不可抗力因素导致
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十条，因不可抗力不能履行民事义务的，不承担民事责任。不可抗力是指不能预见、不能避免且不能克服的客观情况，如暴雨引发的洪水、道路塌陷、交通瘫痪等。
- 具体分析：当暴雨达到灾难性级别，严重影响员工出行，且员工无论采取何种合理出行方式都无法按时到达工作岗位时，此暴雨可被视为不可抗力。在此情况下，用人单位扣奖金是不合法的。若政府发布相关通告，明确暴雨的严重性及其对出行的影响，则更加强了这一判断的依据。
遵循用人单位特殊规定或履行请假手续
- 法律依据：用人单位依法制定的规章制度对劳动者具有约束力，但该规章制度应合理且不违反法律法规的强制性规定。
- 具体分析：若用人单位有针对恶劣天气等特殊情况的特殊规定，如允许在暴雨等恶劣天气下迟到一定时间内不扣奖金，或设有相应的请假流程，并且员工已按照这些规定履行了请假手续或符合特殊规定的情形，则用人单位扣奖金同样是不合法的。
二、可能合法的情况
- 未采取合理措施或超出合理范围
- 具体分析：尽管遇到暴雨天气，但若员工未采取合理的出行方式（例如在有公共交通可正常通行的情况下仍选择自驾，导致因道路积水而迟到），或者迟到时间过长、超出了合理的范围（如暴雨对交通的影响一般在1-2小时内缓解，而员工迟到3-4小时），且用人单位有明确合理的考勤制度，那么在这种情况下，用人单位根据制度扣奖金可能是合法的。这是因为员工未能尽到合理的注意和努力义务，以减轻或避免迟到带来的不利影响。
法律建议
- 员工角度：在遇到暴雨等恶劣天气时，员工应尽量采取合理的出行方式，并提前与用人单位沟通，说明情况并尽量履行请假手续。若因不可抗力导致迟到，可保留相关证据（如政府通告、交通状况照片等），以备不时之需。
- 用人单位角度：建议用人单位在制定相关规章制度时，充分考虑恶劣天气等特殊情况，明确相关规定，如允许在暴雨等恶劣天气下迟到一定时间内不扣奖金，或设有相应的请假流程。这样既可以减少因此类问题引发的劳动争议，也可以体现用人单位的人文关怀。
若您在暴雨天迟到后被扣奖金，且认为此举不合法，或有其他关于劳动工伤（工资福利）的法律问题，欢迎直接向我咨询。