结论：工资没有在合同中体现时，是可以单独签订协议来明确工资相关事宜的。
法律背景与解释：
合同自由原则：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。在劳动合同的签订过程中，双方享有合同自由原则，即双方有权自主约定合同的内容，包括工资、工作时间、休息休假等条款。因此，如果原劳动合同中没有明确工资条款，双方完全可以通过签订补充协议的方式来明确。
补充协议的效力：单独签订的关于工资的协议，作为原劳动合同的补充，具有与原劳动合同同等的法律效力。只要该协议是双方真实意思的表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，就是合法有效的。
实际操作建议：
明确协议内容：在签订单独协议时，应明确工资的具体数额、支付方式、支付时间等关键信息，以避免后续产生争议。例如，可以约定“甲方（用人单位）每月XX日以银行转账方式支付乙方（劳动者）工资人民币XX元”。
双方签字盖章：协议应由双方签字或盖章确认，以确保协议的真实性和有效性。如果是电子协议，也应确保有双方电子签名的确认。
保留协议副本：双方应各自保留一份协议副本，以备后续查阅和维权之需。
可能的风险与防范：
协议内容违法：如果单独签订的协议中关于工资的条款违反了法律、行政法规的强制性规定，如低于当地最低工资标准等，那么该条款将被视为无效。因此，在签订协议前，双方应了解并遵守相关法律法规。
协议被篡改：为了防止协议在签订后被篡改，双方可以在签订协议时约定采用防篡改技术，如使用电子签名、时间戳等。同时，保留好协议的原始版本和签订过程中的相关证据。
后续行动建议：
如果在签订单独协议后，用人单位未按照协议约定支付工资，劳动者可以依法向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，也可以直接向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。