结论：公司员工做五休二，开了三天病假且病假扣工资，这个星期没有休息，是否违法需分情况讨论，不能一概而论。
分析如下：
关于病假工资的扣除：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及各地具体的劳动法规，员工在病假期间，公司通常需要支付一定比例的病假工资，而不是全额扣除。具体比例可能因地区和公司政策而异，但一般不应低于当地最低工资标准的80%。
- 如果公司全额扣除病假期间的工资，这很可能违反了相关法律法规，员工有权要求公司补发病假工资差额。
关于休息日的安排：
- 做五休二的工作制度意味着员工每周有两天休息日。如果员工因病假而未能享受这两天的休息，且公司未安排补休或支付加班费，这本身并不直接构成违法，因为病假是员工因健康原因无法工作的特殊情况。
- 然而，如果公司因员工病假而调整其工作安排，导致员工在病假期间或之后的工作日增加，且未给予相应的补偿（如补休或加班费），则可能涉及违法。特别是如果这种调整违反了劳动合同或公司规章制度中的相关规定。
综合判断：
- 在本案例中，关键在于公司是否按照法律法规支付了病假工资，以及是否因病假调整了员工的工作安排而未给予相应补偿。
- 如果公司既全额扣除了病假工资，又未因调整工作安排而给予员工补偿，那么公司的行为很可能违法。员工有权向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
建议：
- 员工应首先查阅自己的劳动合同和公司规章制度，了解病假工资支付标准和休息日安排的相关规定。
- 如果认为公司的行为违法，员工可以与公司进行沟通协商，要求公司补发病假工资差额或给予相应补偿。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
示例说明：
假设某员工每月工资为5000元，按照当地规定，病假工资应不低于最低工资标准的80%（假设最低工资标准为2000元，则病假工资至少为1600元）。如果该员工开了三天病假，公司应支付其病假工资（按实际工作天数比例计算，若整月病假则至少支付1600元），而不是全额扣除。同时，如果公司因病假调整了员工的工作安排，导致员工在病假期间或之后的工作日增加，且未给予补休或加班费，员工也有权要求公司给予相应补偿。