结论前置：员工在工厂上班期间突发疾病，超过48小时死亡，一般情况下不能被视为工伤，但在特定情况下，如能提供充分证据证明死亡与工作存在紧密因果关系，仍有可能争取到视同工伤的认定。以下是对此问题的详细分析：
一、非工伤情况下的赔偿
基本医疗保险报销：
- 如果员工参加了基本医疗保险，其因病治疗期间产生的符合医保报销目录的医疗费用，可以通过基本医疗保险进行报销。报销比例和范围依据当地医保政策而定，通常住院治疗报销比例在70%至90%之间。
单位福利待遇：
- 病假工资：根据员工在本单位的工作年限和患病时间，用人单位应支付病假工资。该工资可低于当地最低工资标准，但不能低于最低工资标准的80%。
- 其他福利：若单位有补充商业保险、疾病救助金等福利政策，员工或其家属可获得相应经济补偿。
民事赔偿（第三方责任）：
- 如果员工突发疾病系由第三方侵权行为导致，如工作场所环境污染或他人故意伤害，员工或其家属可向第三方追究民事赔偿责任，要求赔偿医疗费、护理费、误工费、死亡赔偿金等损失。
二、特殊情况下的工伤认定及赔偿
特殊情况的考虑：
- 尽管《工伤保险条例》规定了在工作时间和工作岗位突发疾病并在48小时内死亡才视同工伤，但在某些特殊情况下，如长期高强度工作导致身体过度疲劳进而诱发疾病最终死亡，且有医疗诊断、工作时间记录、同事证言等证据支持，仍可尝试通过法律途径争取视同工伤认定。
- 另一种特殊情况是，如果员工在48小时内已经处于脑死亡或植物人状态，且这种状态与工作时间突发疾病有直接因果关系，在某些地区或特定情况下也可能被认定为工伤。
视同工伤的赔偿标准（若成功认定）：
- 丧葬补助金：为6个月的统筹地区上年度职工月平均工资。计算公式为：\(丧葬补助金 = 6 \times 统筹地区上年度职工月平均工资\)。例如，若当地上年度职工月平均工资为5000元，则丧葬补助金为30,000元。
- 一次性工亡补助金：为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。计算公式为：\(一次性工亡补助金 = 20 \times 上一年度全国城镇居民人均可支配收入\)。以2023年为例，全国城镇居民人均可支配收入约为50,000元，因此一次性工亡补助金约为1,000,000元（具体数额每年调整）。
- 供养亲属抚恤金：按照员工本人工资的一定比例发给由因工死亡员工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属。具体比例为配偶每月40%，其他亲属每人每月30%，孤寡老人或孤儿每人每月增加10%，但各供养亲属的抚恤金之和不应高于因工死亡员工生前的工资。计算公式可以简化为：\(各供养亲属抚恤金之和 \leq 员工生前工资\)，且各亲属按比例分配。
三、建议与措施
- 预防为主：企业和员工应加强劳动安全卫生管理，提供健康的工作环境，并鼓励员工定期进行健康检查。
- 积极配合调查：在发生此类事件时，企业和员工应积极配合相关部门进行调查和处理，确保员工的权益得到保障。
- 法律途径：对于具体情况的法律认定和赔偿问题，建议及时向我咨询以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，员工在工厂上班期间突发疾病超过48小时死亡的情况下，赔偿方式和法律认定需综合考虑多种因素。虽然一般情况下不被视为工伤，但在特定条件下仍有可能争取到视同工伤的认定和相应的赔偿。因此，企业和员工都应充分了解相关法律法规和政策规定，以便在必要时采取正确的应对措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。