结论：公司明知员工有基础病还安排值班，是否违法需分情况讨论，主要取决于该安排是否违反了关于劳动保护、特殊员工群体权益保护的相关法律规定，以及是否对员工造成了实际损害。
分析如下：
从劳动保护的角度分析：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位有义务为劳动者提供必要的劳动保护条件，确保劳动者在劳动过程中的安全与健康。如果员工的基础病属于需要特殊照顾或避免特定工作环境的疾病，而公司明知这一点仍安排其值班，且该值班工作可能对其健康造成不利影响，那么公司的行为可能构成对劳动保护义务的违反。
从特殊员工群体权益保护的角度分析：
- 对于患有特定疾病（如职业病、传染病等）或处于特殊生理状态（如孕期、哺乳期等）的员工，法律往往规定了更为严格的保护措施。如果员工的基础病属于这类需要特殊保护的疾病或状态，公司安排其值班可能违反了相关法律规定，侵犯了员工的合法权益。
从实际损害的角度分析：
- 即使公司的安排没有直接违反上述法律规定，但如果该安排实际上对员工的健康造成了损害（如导致病情加重、引发新的健康问题等），员工仍有权要求公司承担相应的法律责任。在这种情况下，公司可能需要承担医疗费用、赔偿损失等民事责任。
法律建议：
- 如果您作为员工，认为公司的安排违反了相关法律规定或对您造成了实际损害，建议您首先与公司进行沟通协商，尝试通过友好方式解决问题。
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报，或者依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁、向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果公司的行为被认定为违法，公司可能需要承担行政责任（如罚款、责令改正等）、民事责任（如赔偿损失、支付医疗费用等）甚至刑事责任（在极端情况下，如因公司行为导致员工重伤或死亡等严重后果时）。
进一步思考：
- 在处理此类问题时，除了考虑法律因素外，还应考虑公司的实际情况、员工的健康状况以及工作性质等多方面因素。例如，如果员工的基础病并不影响其正常工作，且公司已经采取了必要的保护措施，那么公司的安排可能并不违法。
- 同时，员工也应积极了解自己的健康状况和权益保护方面的法律规定，以便在必要时能够维护自己的合法权益。
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