针对农发行员工身患精神障碍的处理办法，这既涉及到劳动法的相关规定，也与社会对精神障碍患者的救助管理政策相关联。以下是一些详细且具有深度的处理建议：

一、劳动法层面的处理

1. 劳动者主体资格与劳动合同履行能力：

   • 根据我国法律，劳动者主体资格主要受年龄条件限制（年满16周岁且未达法定退休年龄），并未禁止限制民事行为能力人建立劳动关系。因此，即使员工被认定为精神障碍患者或限制民事行为能力人，只要其符合年龄条件且具备基本劳动能力，仍然可以成为劳动者，并与用人单位建立劳动关系。
   • 对于已经建立劳动关系的员工，若其被确诊为精神障碍患者，但工作职能简单、工作强度较小，且工作性质和内容与其认知能力相符，那么该员工仍然具备履行劳动合同的能力。用人单位不能仅凭员工患有精神障碍就单方面解除劳动合同。

2. 医疗期待遇与劳动合同解除：

   • 若员工在劳动合同履行期间被确诊为精神障碍患者，用人单位应当依法给予其医疗期待遇。医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。
   • 在医疗期内，员工有权享受病假工资或疾病救济费，且用人单位不得随意解除劳动合同。若医疗期满后，员工不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以按照《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同，并向员工依法支付解除劳动合同的经济补偿。

二、社会救助与管理政策层面的处理

1. 政府管理救助工作专班：

   • 参照三里岗镇《关于严重精神障碍患者管理救助工作专班》的政策，政府可以成立专门的工作专班，负责严重精神障碍患者的管理救助工作。这包括明确人员组成、划分工作职责、建立例会制度、通报制度、督查制度和考核制度等。
   • 工作专班可以联合派出所、卫生院、党群服务中心、社会事务办（民政）、司法所、财政所等多部门，共同推进严重精神障碍患者的早期发现与预防、收治诊疗、登记建册、病情评估和随访管理等工作。

2. 具体救助措施：

   • 对于符合条件的困难严重精神障碍患者家庭，可以按规定纳入低保、临时救助等社会救助范围，并落实残疾人“两项补贴”（生活补贴、护理补贴）政策。
   • 卫生院可以联合相关部门，为精神障碍患者提供必要的医疗服务和康复指导，确保其得到及时有效的治疗。
   • 派出所可以加强对严重精神障碍患者的日常管控和排查稳控工作，防止其发生肇事肇祸行为。

三、农发行内部处理建议

1. 建立员工健康档案：

   • 农发行可以建立员工健康档案，定期组织员工进行体检，包括心理健康检查，以便及时发现员工可能存在的精神障碍问题。

2. 提供心理支持与辅导：

   • 对于已经确诊为精神障碍的员工，农发行可以提供必要的心理支持与辅导，帮助其缓解压力、调整心态，更好地适应工作环境。

3. 调整工作岗位与工作内容：

   • 若员工的精神障碍状况影响其履行原工作岗位的职责，农发行可以根据员工的实际情况，调整其工作岗位或工作内容，确保其能够在力所能及的范围内继续工作。

4. 加强与家属的沟通与合作：

   • 农发行可以加强与员工家属的沟通与合作，共同关注员工的身心健康状况，为其提供必要的支持和帮助。

综上所述，对于农发行员工身患精神障碍的处理办法，需要综合考虑劳动法规定、社会救助与管理政策以及农发行内部实际情况，采取多方面的措施来保障员工的合法权益和身心健康。