建设工程施工合同无效时，结算条款的效力需根据具体情况分析，一般而言，工程价款结算条款在工程质量合格的情况下仍有效，但涉及违约金、赔偿金等第二性义务的清理条款通常无效。以下是对此问题的详细分析：
一、工程价款结算条款的效力
工程质量合格的情况：
- 根据《中华人民共和国民法典》第七百九十三条，建设工程施工合同无效，但建设工程经验收合格的，可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。这意味着，即使合同无效，只要工程质量合格，承包人仍有权请求参照合同约定支付工程价款。
- 实例说明：如甲建筑公司与乙开发商签订的建设工程施工合同因违反招投标程序被认定无效，但工程经竣工验收合格，甲公司仍有权按合同约定要求乙开发商支付工程款。
计价方式条款：
- 合同约定的固定总价、固定单价或可调价格等方式计算工程价款的条款，在工程质量合格的情况下，仍可参照执行。这符合最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定。
工程价款支付时间和支付方式条款：
- 这些条款明确了发包人支付工程折价补偿款的具体要求和流程，在工程质量合格的情况下，对双方结算具有参考意义。
二、清理条款的效力
涉及工程价款支付、结算的清理条款：
- 如前所述，这类条款在工程质量合格的情况下，可以参照合同约定进行处理。
涉及违约金、赔偿金等其他事项的清理条款：
- 这些条款并非合同的主要义务，而是基于合同有效的基础上产生的第二性义务。因此，在建设工程施工合同无效的情况下，这些条款通常应认定为无效。实例说明：如合同中约定了因承包人原因导致工期延误需支付高额违约金，但合同因违反法律强制性规定被认定无效，则该违约金条款也无效。
三、特殊情况下的结算条款效力
转包、违法分包与挂靠情形：
- 在转包、违法分包及挂靠关系中，实际施工人虽不具备直接主张工程款的合同依据，但基于保护农民工权益等考量，可突破合同相对性向发包人主张权利。此时需结合各方过错程度、实际施工贡献等因素综合判定责任分担比例，但结算条款的效力仍需根据工程质量及合同约定进行判断。
未完工工程的结算：
- 对于未完工程，可通过司法鉴定评估已完成部分的价值，或参照定额标准、市场价格信息计算已完工程量对应的价款。此时，结算条款的效力可能因工程未完工而受到影响，但已完部分的结算仍可参照合同约定或相关标准进行。
四、法律建议
- 确保工程质量：无论合同是否有效，工程质量始终是首要考虑的因素。双方应确保工程质量符合标准，以作为结算依据。
- 明确合同条款：在签订建设工程施工合同时，双方应明确约定工程价款、计价方式、支付时间等关键条款，以减少合同无效时的争议。
- 及时协商与调解：在合同无效或发生争议时，双方应尽量通过协商和调解解决争议，避免法律纠纷。
- 保留证据：无论是协商还是诉讼，都应妥善保管相关文件和资料作为证据，以便在争议解决过程中维护自身权益。
综上所述，建设工程施工合同无效时，结算条款的效力需根据具体情况进行细致分析。在实际操作中，应充分考虑建设工程的特殊性以及相关法律法规的具体规定，以确保各方权益得到妥善处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。