申请劳动能力鉴定时停工留薪期未勾选，主要可能产生的后果是影响停工留薪期的确认流程，但并不意味着您无法获得应有的停工留薪期待遇，您仍有机会通过后续程序进行补正和确认。以下是对此问题的详细分析：
一、停工留薪期确认的重要性
停工留薪期是劳动者因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的期间。在此期间，用人单位应按月支付劳动者原工资福利待遇，这是劳动者的合法权益。因此，准确确认停工留薪期对于保障劳动者的权益至关重要。
二、未勾选停工留薪期的可能后果
影响确认流程：在申请劳动能力鉴定时，如果未勾选停工留薪期，可能会导致鉴定机构在出具鉴定结论时未对停工留薪期进行明确确认。这可能会使得后续确认停工留薪期的流程变得复杂或需要额外的步骤。
不意味着无法获得待遇：尽管未勾选停工留薪期可能会影响确认流程，但并不意味着劳动者无法获得应有的停工留薪期待遇。劳动者仍可以通过与用人单位协商、向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁等方式，要求用人单位支付停工留薪期的工资福利待遇。
三、后续补正和确认的建议
及时与用人单位沟通：如果发现申请劳动能力鉴定时未勾选停工留薪期，劳动者应及时与用人单位沟通，说明情况，并要求用人单位协助办理停工留薪期的确认手续。
向鉴定机构申请补正：如果鉴定结论已经出具，但未包含停工留薪期的确认，劳动者可以向鉴定机构申请补正或重新鉴定，要求鉴定机构对停工留薪期进行明确确认。
寻求法律援助：如果与用人单位协商无果，或者鉴定机构拒绝补正或重新鉴定，劳动者可以寻求法律援助，向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，以维护自己的合法权益。
四、法律依据
根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。因此，劳动者有权要求用人单位支付停工留薪期的工资福利待遇。
总结来说，申请劳动能力鉴定时未勾选停工留薪期可能会影响确认流程，但劳动者仍有机会通过后续程序进行补正和确认，以获得应有的停工留薪期待遇。如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。