央企三级单位是否每年查犯罪记录并无统一强制性规定，需分情况讨论：

1. 法律层面无强制年检要求
   根据《刑法》第一百条及《刑事诉讼法》第二百八十六条，犯罪记录封存制度（针对未成年人犯罪）和特定岗位背景审查（如国家安全、金融监管等）有明确法律依据，但现行法律未规定企业需对员工进行年度犯罪记录核查。央企三级单位作为普通市场主体，无权突破法律框架自行设定强制性年检义务。

2. 央企内部管理自主权范围

   • 特定岗位触发核查：若员工岗位涉及国家秘密、金融资金、安全生产等特殊职责，单位可能依据《劳动合同法》第八条及《安全生产法》第四十一条，在入职、晋升或岗位调整时进行犯罪记录审查，但通常不会扩大至全体员工年度普查。
     
   • 合规风险防控需求：部分央企为防范贪腐、职务侵占等风险，可能通过内部制度要求关键部门（如财务、采购）定期提交无犯罪记录证明，但此类措施需符合《个人信息保护法》第十三条规定的”为履行法定职责或者法定义务所必需”原则，且需经员工书面同意并明确告知用途。

3. 实务操作中的例外情形

   • 行业监管要求：若央企三级单位所属行业（如金融、能源）受银保监会、国家能源局等监管机构约束，可能被要求对特定岗位人员实施定期背景审查，但审查主体通常为监管机构而非企业自身。
     
   • 涉诉涉案关联核查：当单位涉及重大法律纠纷或员工被列入失信被执行人名单时，可能通过合法途径（如法院协查）获取相关信息，但这属于个案处理而非年度常规动作。

建议：若您所在单位拟实施犯罪记录年度核查，需重点审查：

• 核查范围是否限于法律明确规定的岗位；
  
• 是否取得员工书面授权；
  
• 核查结果使用是否符合最小必要原则。
  如有具体操作疑问，可直接向我咨询企业合规管理相关问题。