针对您提出的“职工失踪报案后停发工资的根据是什么”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
一、基本原则
首先，需要明确的是，职工工资的发放是基于其提供了劳动这一前提。如果职工因失踪而未能提供劳动，那么用人单位在特定情况下有权暂停支付工资。但这一决定并非随意作出，而是需要依据职工的失踪原因、时间以及法律状态来综合判断。
二、具体情形分析
劳动关系存续且在正常提供劳动期间失踪
- 如果职工在正常提供劳动过程中失踪，对于失踪前已正常工作的部分，用人单位有义务按照劳动合同约定和国家规定及时足额支付工资。这是因为劳动者已经付出了劳动，用人单位应履行支付劳动报酬的法定义务。
失踪期间的工资处理
- 短期内失踪且有正当理由：如职工因突发急病被送医等正当理由短期失踪，用人单位可根据具体情况按病假等相关规定处理，可能会支付部分工资，通常不低于当地最低工资标准的一定比例。
- 无正当理由长期失踪：若职工无正当理由长期失踪，未向用人单位提供劳动，则用人单位可以暂停支付工资。因为工资支付的前提是劳动者提供了劳动，长期失踪视为未履行劳动义务。
宣告失踪或死亡后的工资与劳动关系
- 宣告失踪：根据《中华人民共和国民法典》，自然人下落不明满二年，利害关系人可向人民法院申请宣告其为失踪人。职工被宣告失踪后，其财产由财产代管人代管，用人单位无需再向失踪职工支付工资，但财产代管人有权代失踪职工主张此前未结算的劳动报酬。
- 宣告死亡：自然人下落不明满四年，或因意外事件下落不明满二年且经有关机关证明不可能生存，利害关系人可向人民法院申请宣告其死亡。职工被宣告死亡后，其与用人单位的劳动关系自然终止，用人单位无需再支付工资。
三、特殊情况考虑
- 若职工因工作原因失踪或发生意外下落不明，在其失踪当月，用人单位应照发工资。从第二个月开始，其家人可代领工资，但这需具体依据公司规章制度和双方协商情况来确定。
- 若职工无故旷工导致失踪，用人单位停发工资是合理的，并可根据公司规章制度采取进一步措施，如解雇等。
四、总结与建议
综上所述，职工失踪后停发工资的依据主要取决于职工的失踪原因、时间以及法律状态。用人单位在处理此类问题时，应综合考虑各种因素，并依据相关法律法规和公司规章制度作出合理决策。同时，为了避免潜在的法律风险，建议用人单位完善内部管理制度，明确相关情况下的工资支付规定。对于复杂或争议较大的情况，建议及时咨询专业法律意见以确保合规处理。