结论前置：工伤住院时，向公司借医药费这一行为本身并不直接涉及违法性，但其合法性与合理性需结合具体情况及双方约定来判断。

1. 法律层面分析

• 无直接禁止性规定：我国现行劳动法律法规（如《工伤保险条例》、《劳动法》等）并未明确禁止员工在工伤住院期间向公司借款支付医药费。这一行为属于民事借贷范畴，只要双方自愿、平等协商，且不违反法律强制性规定（如高利贷），即具有法律效力。
• 工伤保险责任：根据《工伤保险条例》，用人单位有义务为员工缴纳工伤保险，员工发生工伤后，医疗费用应由工伤保险基金支付。若公司未依法缴纳工伤保险，则需自行承担全部工伤待遇费用。此时，公司借款给员工支付医药费，可视为对自身义务的履行方式之一，但需明确借款性质（如是否视为预付工伤待遇）。

2. 实践操作建议

• 明确借款性质：建议双方签订书面借款协议，明确借款金额、用途（仅限工伤医疗）、还款方式及期限。若借款实质为预付工伤待遇，可约定从后续工伤保险赔付或公司应承担的费用中抵扣。
• 避免纠纷风险：若公司拒绝借款，员工可依法申请工伤保险先行支付（需符合《社会保险基金先行支付暂行办法》条件），或通过劳动仲裁要求公司承担工伤待遇。反之，若公司借款后要求员工承担非工伤费用或高额利息，则可能涉及违法。

3. 特殊情况处理

• 公司未缴工伤保险：若公司未依法参保，员工发生工伤后，公司需承担全部医疗费用。此时借款可能被视为公司履行义务的方式，但员工仍需保留相关证据（如工伤认定书、医疗票据），以便后续维权。
• 借款与工伤待遇冲突：若借款金额超过公司应承担的工伤待遇范围，或公司以借款为由拒绝申报工伤，员工可拒绝还款并主张权利。

4. 法律后果提示

• 公司风险：若借款协议存在显失公平条款（如高额利息、强制担保），可能被认定为无效；若公司以借款为由拖延工伤认定或赔付，需承担行政处罚及民事赔偿责任。
• 员工风险：若借款用于非工伤医疗或未按约定还款，可能面临民事诉讼；但若能证明借款与工伤直接相关，且公司未履行法定义务，员工可主张免除还款责任。

总结建议：工伤住院时向公司借款支付医药费，需以书面协议明确双方权利义务，避免口头约定。若公司配合，可视为临时解决方案；若公司拒绝或设置不合理条件，员工应优先通过工伤保险或劳动仲裁途径维权。如有具体协议条款或纠纷，可进一步向我咨询细节。