结论：工资超支且员工离职本身并不直接构成违法，但具体是否违法需根据超支的原因、性质以及是否违反相关法律法规或劳动合同约定来判断。以下从不同角度进行分析：
一、工资超支的合法性分析
正常发放工资超支：
- 如果是因为公司财务计算错误、多发工资等非故意行为导致工资超支，且员工在不知情的情况下接受了超额支付的工资，这通常不构成违法。但公司有权要求员工返还超额支付的部分，这是基于不当得利的原则。
违反劳动合同或法律法规的超支：
- 如果工资超支是因为公司违反了与员工签订的劳动合同中的工资条款，或者违反了国家关于工资支付的法律法规（如最低工资标准、加班费支付等），那么这种超支就可能构成违法。例如，公司故意少报加班时间以减少加班费支出，但实际上支付了全额加班费（看似超支，实则是之前少报导致的补发），若这种行为违反了加班费支付的相关规定，则可能面临法律责任。不过，这种情况下的“超支”更多是表象，实质是公司之前存在违法行为。
二、员工离职与工资超支的关系
员工正常离职：
- 员工因个人原因（如找到新工作、家庭原因等）正常离职，且离职时工资已经结清（包括可能的超额支付部分），这通常不会引发法律问题。公司若发现工资超支，可与员工协商返还，若员工拒绝，公司可通过法律途径追讨。
员工因公司违法行为离职：
- 如果员工是因为公司存在违法行为（如拖欠工资、未支付加班费等）而离职，且离职时公司为了弥补之前的违法行为而支付了超额工资，这种情况下，员工离职本身并不违法，且公司支付超额工资可能是为了弥补之前的过错。但公司仍需确保所有工资支付都符合法律法规和劳动合同的约定。
三、可能的法律后果
公司要求返还超额工资：
- 如果工资超支是由于公司财务错误或非故意行为导致的，公司有权要求员工返还超额支付的部分。员工若拒绝返还，公司可通过法律途径（如起诉）追讨。
公司因违法行为面临处罚：
- 如果工资超支是因为公司违反了相关法律法规或劳动合同约定，公司可能面临劳动行政部门的处罚（如罚款、责令改正等），并可能需要向员工支付赔偿金或补发工资差额。
建议：对于公司而言，应建立健全的财务管理制度，确保工资支付的准确性和合法性；对于员工而言，若发现工资异常（如超额支付），应及时与公司沟通并了解原因，避免不必要的法律纠纷。若您在工资福利方面遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。