店长使用店里手机发放工资是否违法，需分情况讨论：

1. 若店长获得公司明确授权：

   • 法律分析：若店长作为公司员工，被公司明确授权使用公司财产（包括手机）进行工资发放等职务行为，且该行为符合公司规章制度及财务管理流程，则此行为不构成违法。因为在此情况下，店长是在履行其职务职责，且行为具有合法性和正当性。
   • 建议：公司应确保授权明确，并建立完善的财务管理制度，以规范此类行为，避免潜在纠纷。

2. 若店长未经公司授权或超出授权范围：

   • 法律分析：若店长未经公司明确授权，或超出授权范围使用公司手机发放工资，可能构成对公司财产的侵占或滥用职权。根据《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规，公司财产应由公司统一管理和使用，未经授权，任何员工不得擅自处置。此外，若店长通过此行为谋取私利或损害公司利益，还可能涉及职务侵占、挪用资金等刑事犯罪。
   • 后果：店长可能面临公司内部的纪律处分，如警告、罚款、解雇等。同时，若行为构成犯罪，店长还可能面临刑事追究，包括有期徒刑、罚金等刑罚。
   • 建议：公司应加强对员工行为的监督和管理，确保员工在授权范围内履行职责。一旦发现员工有擅自处置公司财产或滥用职权的行为，应立即采取措施予以制止，并依法追究其责任。

3. 若涉及手机所有权及使用权限的争议：

   • 法律分析：若手机的所有权或使用权存在争议（如手机为公司所有但店长个人使用、手机为店长个人所有但用于公司业务等），则店长使用手机发放工资的行为可能涉及物权纠纷。在此情况下，需根据手机的所有权及使用权限来确定行为的合法性。
   • 建议：公司应明确手机的所有权及使用权限，避免员工个人财产与公司财产混同。若发生争议，应及时通过协商、调解或诉讼等方式解决，以维护公司的合法权益。

总结与提醒：店长使用店里手机发放工资是否违法，取决于其是否获得公司授权、是否超出授权范围以及手机的所有权及使用权限等因素。为避免潜在的法律风险，公司应建立完善的授权制度和财务管理制度，明确员工职责和权限。同时，员工也应严格遵守公司规章制度和法律法规，不得擅自处置公司财产或滥用职权。若您在此方面遇到任何问题或疑虑，可直接向我咨询，我将为您提供专业的法律意见。