结论：生意不好让员工休息几个月，放假来后每月补1000元的做法是否合法，需分情况讨论，主要取决于是否符合相关法律法规的规定以及劳动合同的约定。
分析：
从劳动合同和法律法规的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。劳动合同中应当明确约定工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等关键条款。
- 如果劳动合同中并未约定在生意不好时可以让员工休息并降低工资或补贴的条款，那么用人单位单方面做出这样的决定可能构成违约，需要承担相应的法律责任。
- 即使劳动合同中有相关约定，也需要确保该约定不违反法律法规的强制性规定，如最低工资标准、休息休假权利等。
从工资支付和最低工资标准的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的规定，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。如果每月补贴的1000元低于当地最低工资标准，那么这种做法显然是不合法的。
- 此外，即使补贴金额不低于最低工资标准，但如果员工在休息期间并未提供劳动，而用人单位却要求员工承担某些费用或扣除其他福利，这也可能构成违法。
从员工权益保护的角度：
- 员工有权获得与其劳动相对应的报酬，也有权享受法定的休息休假权利。如果用人单位因为生意不好而单方面决定让员工休息并降低工资或补贴，这可能侵犯了员工的合法权益。
- 在这种情况下，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位按照劳动合同的约定支付工资和福利。
建议：
- 对于用人单位：在做出让员工休息并降低工资或补贴的决定前，应仔细审查劳动合同的约定和法律法规的规定，确保决策合法合规。如果确实需要调整工资或福利，应与员工进行充分沟通并达成一致意见，同时签订书面协议以避免后续纠纷。
- 对于员工：如果遇到用人单位单方面降低工资或补贴的情况，应首先查看劳动合同的约定和法律法规的规定，了解自己的权益和义务。如果认为用人单位的做法违法或侵犯了自己的权益，可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果用人单位的做法被认定为违法或违约，可能需要承担补发工资、支付经济补偿金、赔偿损失等法律责任。
- 对于员工而言，如果成功维权，可能获得相应的工资补发、经济补偿等；如果维权失败，则可能需要接受用人单位的决定或继续通过法律途径寻求救济。
总之，生意不好让员工休息几个月并每月补1000元的做法是否合法，需根据具体情况进行判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。