若员工在上班途中发生交通事故且被认定为工伤，尽管员工在事故中负主要责任，单位仍需承担一定的赔付责任；若未被认定为工伤，单位则无需承担赔付责任。以下是对此问题的详细分析：
一、认定为工伤的情况
工伤认定条件：
- 根据《工伤保险条例》第十四条第六项，员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。但此处需注意，若员工负主要责任，则不符合此项工伤认定条件。然而，若存在其他符合工伤认定的情形（如因工作原因外出期间发生事故等），则仍可能被认定为工伤。
单位赔付责任：
- 若员工被认定为工伤，单位需承担以下费用：
- 医疗费用：包括诊疗费、药费、住院费等，由工伤保险基金支付。若单位未为员工缴纳工伤保险，则这些费用由单位承担。
- 住院伙食补助费：员工住院治疗工伤期间的伙食补助费，由工伤保险基金支付。
- 交通、食宿费用：经医疗机构出具证明，报经办机构同意，员工到统筹地区以外就医所需的交通、食宿费用，由工伤保险基金支付。
- 停工留薪期工资：员工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由单位按月支付。
- 伤残津贴和一次性伤残就业补助金：若员工因工伤造成伤残，根据伤残等级，由工伤保险基金支付一次性伤残补助金，并由单位支付伤残津贴（五级、六级伤残）或一次性伤残就业补助金（五级至十级伤残，在解除或终止劳动合同时支付）。
二、未被认定为工伤的情况
非工伤认定条件：
- 若员工在上班途中发生的交通事故，且被认定为负主要责任，同时不符合其他工伤认定条件，则该事故不被认定为工伤。
单位赔付责任：
- 在非工伤情况下，单位无需承担因交通事故导致的赔付责任。员工应依据交通事故责任认定，向责任方（如其他车辆驾驶员、保险公司等）主张赔偿。
三、建议与注意事项
及时申请工伤认定：
- 员工在发生交通事故后，应及时向单位报告，并由单位在规定时间内（通常为30日内）向社会保险行政部门提出工伤认定申请。若单位未按时申请，员工或其近亲属可在1年内直接提出申请。
保留相关证据：
- 员工应保留与交通事故相关的所有证据，包括交通事故责任认定书、医疗费用单据、住院记录等，以便在申请工伤认定或主张赔偿时使用。
咨询专业律师：
- 在处理此类复杂法律问题时，建议员工或单位咨询专业律师，以确保权益得到妥善维护。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供更为详细和专业的法律建议。