结论：上游公司开具的发票只有金额没有数量和单价，是否合法需分情况讨论，具体如下：

1. 从增值税专用发票的角度分析
   根据《增值税专用发票使用规定》第十二条，增值税专用发票的基本内容包括发票名称、发票代码、号码、日期、购销双方纳税人识别号、开户银行及账号、货物或应税劳务名称、规格型号、单位、数量、单价、金额、税率、税额等。若开具的是增值税专用发票，数量和单价属于法定必须填写的项目，未填写则不符合规定，可能被认定为不合规发票。
   实践中，税务机关在核查时，若发现专用发票缺少数量或单价，可能要求企业补正或重新开具，否则不得作为进项税额抵扣凭证或企业所得税税前扣除凭证。

2. 从普通发票的角度分析
   根据《发票管理办法》及其实施细则，普通发票的开具要求相对灵活，但需保证“项目填写齐全、内容真实”。若开具的是普通发票，法律未强制要求必须填写数量和单价，但需确保发票内容与实际交易一致。例如，若交易按总额结算（如服务费、打包销售），且双方对交易内容无异议，仅填写金额可能被接受；但若交易涉及具体货物且数量、单价是合同核心条款，未填写可能引发争议，税务机关也可能要求补充说明。

3. 从合同与交易实质的角度分析
   即使发票形式上符合要求，若实际交易中数量和单价是合同关键条款（如买卖合同明确约定“单价XX元/件，共XX件”），而发票未体现，可能引发以下风险：

   • 税务风险：税务机关可能认为交易真实性存疑，要求企业提供合同、付款凭证等佐证材料；
     
   • 民事风险：若发生纠纷，对方可能以发票内容与合同不符为由，主张交易条款未履行或存在欺诈；
     
   • 刑事风险：在极端情况下，若故意通过模糊发票内容隐瞒真实交易（如虚开发票），可能涉嫌逃税罪或虚开发票罪。

建议：

• 若您收到此类发票，首先核对交易类型（货物/服务）及合同约定。若合同明确要求数量和单价，应要求上游公司重新开具合规发票；
  
• 若交易按总额结算且无合同强制要求，可保留合同、送货单等佐证材料，以备税务核查；
  
• 长期合作中，建议在合同中明确发票开具标准（如“发票需包含数量、单价”），避免后续争议。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的处理方案。