关于公司发了两笔钱但只签了一个字是否合法的问题，这并非一个简单的“合法”或“不合法”的判断，而是需要根据具体情况来详细分析。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、合同或协议的签订与履行
合同或协议的完整性：
- 如果公司发放的两笔钱是基于同一份合同或协议，且该合同或协议中明确规定了发放两笔钱的条款，那么只签一个字（假设是指在该合同或协议上签字）可能是合法的，前提是签字行为代表了双方对合同或协议内容的认可和接受。
- 如果两笔钱分别对应两份不同的合同或协议，而只签了一个字（即只签署了一份合同或协议），那么对于未签署的合同或协议对应的款项发放，可能存在法律风险，因为未签署的合同或协议对双方可能没有约束力。
签字行为的法律效力：
- 签字是合同或协议成立的重要要件之一，它代表了签字人对合同或协议内容的认可和接受。但是，签字行为必须是在自愿、平等、公平的基础上进行的，且签字人必须具备相应的民事行为能力。
- 如果签字行为存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，或者签字人无民事行为能力或限制民事行为能力，那么签字行为可能无效，进而影响合同或协议的法律效力。
二、公司财务与会计制度
财务记录的完整性：
- 公司发放两笔钱，无论是否基于同一份合同或协议，都应当在财务记录中完整、准确地反映出来。这包括款项的发放时间、金额、用途等信息。
- 如果财务记录不完整或存在错误，可能会引发内部管理问题或外部监管风险。
内部控制的有效性：
- 公司应当建立有效的内部控制制度，确保款项的发放符合公司政策和相关法律法规的要求。这包括审批流程、签字权限、资金监管等方面的规定。
- 如果内部控制制度存在缺陷或执行不到位，可能会导致款项发放的违规行为，进而引发法律风险。
三、法律建议与风险提示
审查合同或协议：
- 如果您对公司发放两笔钱但只签了一个字的行为存在疑虑，建议首先审查相关的合同或协议，确认其内容是否明确、完整，以及签字行为是否合法有效。
咨询专业律师：
- 如果您无法自行判断该行为的合法性，或者担心可能存在的法律风险，建议咨询专业律师。律师可以根据您的具体情况，提供详细的法律分析和建议。
完善公司制度：
- 从公司管理的角度来看，建议完善相关的财务和会计制度，以及内部控制制度，确保款项的发放符合公司政策和相关法律法规的要求，降低法律风险。
如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供详细的法律分析和建议。