核心结论：工程完工两年后甲方才支付农民工工资，若存在拖欠情况，可通过协商、投诉、申请仲裁或提起诉讼等途径来维权。

核心前提：工程已完工两年，甲方才支付农民工工资，可能存在拖欠工资的情况，需要明确的是，无论工程完工多久，只要存在拖欠工资的事实，农民工都有权要求支付。

具体分析：

1. 协商解决：

   • 首先，可以尝试与甲方进行协商，明确工资支付的具体情况，包括是否已全额支付、是否存在拖欠以及拖欠的原因等。
   • 如果甲方承认拖欠工资，并承诺在一定期限内支付，可以要求甲方出具书面承诺，以确保权益。

2. 投诉举报：

   • 如果协商无果，或者甲方拒绝支付工资，可以向当地劳动监察部门投诉举报。
   • 投诉时，需要提供相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明与甲方存在劳动关系以及甲方拖欠工资的事实。
   • 劳动监察部门会依法进行调查，并要求甲方支付拖欠的工资。

3. 申请仲裁：

   • 如果投诉举报后问题仍未得到解决，可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
   • 仲裁时，需要提交仲裁申请书以及相关证据材料。
   • 仲裁委员会会依法进行审理，并作出裁决，要求甲方支付拖欠的工资以及可能的赔偿金。

4. 提起诉讼：

   • 如果对仲裁结果不满意，或者甲方不履行仲裁裁决，可以向人民法院提起诉讼。
   • 诉讼时，需要提交起诉状以及相关证据材料。
   • 法院会依法进行审理，并作出判决，要求甲方支付拖欠的工资以及可能的赔偿金和利息等。

特别提醒：

• 在整个维权过程中，务必保留好相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录、投诉举报材料、仲裁申请书、起诉状等，以备不时之需。
• 如果对法律程序不熟悉，或者遇到复杂情况，建议及时寻求专业法律帮助，以确保维权顺利进行。

后续建议：

• 如果在维权过程中遇到任何问题或困难，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和指导。