若在工程类司法鉴定中，被申请人不配合第三方核对工程量，申请人可采取以下措施，且被申请人可能面临相应法律后果：
申请人可采取的措施
向司法机关反馈：
- 申请人应及时向法院或仲裁庭等司法机关反馈被申请人不配合的情况。司法机关有权对这种不配合行为进行处置，例如依照证据规则，对被申请人作出不利的推定。在仲裁程序中，仲裁庭同样拥有类似权力，可以要求被申请人配合或作出相应处理。
申请司法机关采取强制措施：
- 在民事案件中，被申请人有协助进行司法鉴定以明晰案件事实的责任。若被申请人拒不配合，司法机关可采取警告、罚款等手段促使其配合。这些措施旨在确保司法鉴定的顺利进行，维护案件的公正审理。
依据现有证据裁判：
- 若被申请人依旧拒不配合，且有初步证据显示鉴定结果可能对申请人有益，司法机关可依据现有证据作出裁判。这意味着，即使没有完整的工程量核对结果，司法机关也可能根据其他证据和事实，对案件作出合理判断，被申请人可能需承担因其不配合而引发的不利法律后果。
被申请人可能面临的法律后果
不利推定：
- 在民事案件中，若负有举证责任的被申请人无正当理由拒不配合司法鉴定，法院可以依据《民事诉讼法》及相关司法解释，作出对其不利的推定。例如，在侵权案件中，若需鉴定伤残程度，被申请人拒绝鉴定，法院可能按申请人主张的伤残情况判定赔偿责任。
影响罪责认定与量刑（刑事案件）：
- 在刑事案件中，如果涉及专门性问题需要鉴定，犯罪嫌疑人（被申请人）拒绝配合，侦查机关可强制检查、鉴定。若该鉴定对认定犯罪事实至关重要，拒绝行为可能影响对其罪责认定与量刑。法院会结合全案证据作出综合判断，被申请人可能因拒绝鉴定而承担更重的刑事责任。
妨碍司法程序正常进行的后果：
- 被申请人不配合司法鉴定的行为，可能会被视为妨碍司法程序正常进行。这不仅可能影响案件的审理进度，还可能使被申请人面临更严重的法律后果，如被处以罚款、拘留等强制措施。
实际建议：在实际操作中，申请人应保留好与被申请人沟通的记录、司法机关出具的相关文书等证据，以备不时之需。同时，申请人也可以考虑与被申请人进行协商，寻求和解或调解的可能性，以降低诉讼成本和时间成本。若遇到复杂情况或不确定如何处理时，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。