当建设工程合同无效且工程未完工时，首要任务是明确合同无效的原因，并根据不同原因采取相应的处理措施。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

一、合同无效的原因及处理原则

1. 因违法发包、非法转包等导致合同无效

   • 处理原则：若已完工部分质量合格，承包商有权依据原合同约定请求发包方支付工程款；未完工部分需双方协商解决，无法达成共识时，可借助司法鉴定评估已完工程价值，并根据各自过失分摊损失。
   • 法律依据：根据《民法典》及相关建筑工程法规，合同无效但工程验收合格的，承包人请求参照合同约定支付价款的，应予支持。

2. 因承包商缺乏必要资质导致合同无效

   • 处理原则：承包商无法索求合同中约定的工程款项，但可向发包方追讨工程成本；发包方可能因选任承包商过程中的过失而面临法律责任追究。
   • 法律依据：同样依据《民法典》及相关建筑工程法规，合同无效且因承包商资质问题导致的，承包人不能请求参照合同约定支付价款，但可请求折价补偿其实际投入的成本。

二、工程未完工的结算方式

1. 按实际完成工作量及投入成本结算

   • 操作方式：根据实际完成的工作量以及投入的成本来进行结算，可以参照已完成的工程量的比例乘以合同的总价等方式进行。
   • 注意事项：结算过程中需考虑工程质量、进度等因素，由双方协商确定结算方式；协商不成时，可诉至法院，由法院根据实际情况裁决。

2. 考虑工程质量及修复费用

   • 质量合格：若已完工程质量验收合格，发包人应参照无效合同与承包人结算并付款。
   • 质量不合格：若已完工程质量验收不合格且无法修复，则承包人应予以拆除，并向发包人返还已付工程款；若修复后合格，发包人可请求承包人承担修复费用。

三、相关法律后果及责任承担

1. 合同无效的法律后果

   • 财产返还与补偿：从合同中获取的财产应返还，无法返还或没有必要返还的，应按实物价值折算并给予补偿。
   • 过错赔偿：任何一方如有过错，必须对另一方因此遭受的经济损失负有赔偿义务；双方均有过错时，各自承担自己造成的损失责任。
   • 行政责任与刑事责任：合同无效可能导致相关责任人面临行政责任，甚至在某些特殊情况下须承担刑事责任。

2. 责任承担比例

   • 过错程度分析：需具体分析各方在导致合同无效以及工程质量问题上的过错程度，确定最终责任承担比例。
   • 共同过错处理：若双方均有过错，则按过错大小各自承担相应赔偿责任。

四、实际操作建议

1. 立即停止履行合同：一旦合同被确认无效，双方应立即停止履行合同，避免进一步损失。
2. 协商解决：双方应积极协商，就已完工部分的结算、未完工部分的处理等事宜达成共识。
3. 寻求司法鉴定：若无法协商一致，可借助司法鉴定机制对已完成工程的实际价值进行评估，为纠纷解决提供依据。
4. 提起诉讼：若协商和司法鉴定均无法解决问题，可向法院提起诉讼，由法院根据实际情况作出裁决。

综上所述，建设工程合同无效且工程未完工时，需根据合同无效的原因及工程实际情况采取相应的处理措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。