在二审审理阶段中，如果发现有新的犯罪事实出现，通常会遵循以下处理原则和流程：
一、处理原则
发回重审：
- 一般情况下，最高人民法院会将案件发回原审法院重新进行审判。这是因为二审程序主要是对一审判决在事实认定、法律适用和程序方面进行审查，并不直接负责对新罪的侦查与审理。
数罪并罚：
- 待原审法院完成了针对新发现的罪名的审理并且做出相应判决之后，会将新判决与之前判决中所判处的各种刑罚予以合并处理。这通常依据我国《刑法》对于数罪并罚的相关规定来确定最终应执行的刑罚。
- 值得注意的是，已经执行完毕的期限，应当计算在新的判决所判定的期限内。
酌情加重处罚：
- 如果新发现的犯罪与原判决认定的罪名属于同类罪名，原则上来讲并不执行数罪并罚，而是依据实际情况酌情加重处罚力度。但具体的处理办法则要根据案件的真实情况及相关法律法规的具体规定来进行全面的分析和裁决。
二、处理流程
裁定撤销原判：
- 二审法院在发现新罪后，通常会裁定撤销原判，将案件发回原审法院重新审判。
补充侦查与起诉：
- 原审法院将案件退回检察院后，由检察院进行补充侦查，查明新罪事实。之后，检察院会对新罪一并提起公诉。
重新审判：
- 原审法院重新审理时，会对原指控罪行和新发现的罪行一并进行审判，遵循完整的一审程序，保障被告人各项诉讼权利。
- 在重新审判过程中，原审法院会另行组成合议庭，对新罪进行审理。
- 如果新罪与原判决认定的犯罪性质相同，且符合数罪并罚条件的，应一并作出判决，在新罪所判处的刑罚与原判决尚未执行的刑罚之和以下，酌情决定执行的刑罚。
- 如果新罪与原判决认定的犯罪性质不同，应分别作出判决，按照数罪并罚的原则决定执行的刑罚。
三、对最终量刑的影响
- 二审发现新罪会影响最终量刑。因为新罪的发现必然会改变原有的量刑基础，对最终量刑产生实质性影响。原审法院在重新审判时，会根据犯罪的事实、犯罪的性质、情节和对于社会的危害程度，依照法律的有关规定进行定罪量刑。最终依据数罪并罚原则确定宣告刑。
四、特别注意事项
- 在处理二审发现新罪的情况时，新罪的证据收集和审查标准极为关键。新证据是否合法有效、能否有力证明新罪的成立，都直接影响后续走向。
- 另外，二审因新罪处理后，刑罚的并罚规则也不容忽视。不同类型的罪名并罚方式存在差异，需要具体案件具体分析。
综上所述，二审发现新罪时，通常会裁定撤销原判，发回原审法院重新审判，并根据新罪与原罪的性质和关系进行数罪并罚或酌情加重处罚。这一过程中，需要严格遵循法律程序，保障被告人的合法权益，确保案件得到公正的处理。