在二审阶段发现被告有新罪的情况，处理方式需结合具体法律程序和案件性质综合判断，以下是核心结论及分情况说明：

1. 若新罪与原案属于“同种罪行”
   根据《刑事诉讼法解释》第404条，二审法院发现被告在判决宣告前还有同种漏罪的，一般不启动再审程序，而是建议检察院补充起诉。若检察院补充起诉，二审法院可依法并案审理，将新罪与原罪合并量刑；若检察院未补充起诉，二审法院可依据现有证据直接裁判，但需注意避免“重复评价”原则（即新罪事实已作为原罪量刑情节的，不得重复计算）。

2. 若新罪与原案属于“不同种罪行”
   此时需分两种情形处理：

   • 二审法院已裁定维持原判或改判：若二审判决已生效，发现新罪后应由原审法院管辖，通过审判监督程序撤销原判，与新罪数罪并罚；
     
   • 二审法院尚未作出终审裁判：二审法院可裁定撤销原判、发回重审，由原审法院将新罪与原罪合并审理，或直接由二审法院并案处理（需符合级别管辖规定）。

3. 特殊程序衔接问题

   • 若被告在二审期间被指控的新罪处于侦查或审查起诉阶段，二审法院可中止原案审理，待新罪程序终结后恢复审理；
     
   • 若新罪已进入审判程序，二审法院可与新罪审理法院协商合并审理，避免裁判冲突。

实务建议：

• 被告方应主动向二审法院提交新罪证据材料，争取通过发回重审或并案处理获得量刑优势；
  
• 检察院需注意补充起诉的时效性，避免因程序拖延导致被告权利受损；
  
• 法院应严格审查新罪与原罪的关联性，防止“一事再审”或“漏罪不究”。

如有具体案情或证据材料，可进一步向我说明，我会结合《刑法》第69条（数罪并罚）和《刑事诉讼法》第237条（二审发回重审）等条款为您详细分析。