法定节假日休息扣工资是不合法的，用人单位应当依法支付劳动者在法定节假日期间的工资。以下是对这一问题的详细分析：

法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者的合法权益受到严格保护。具体来说：

• 《中华人民共和国劳动法》第五十一条：劳动者在法定休假日、婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位有义务依法支付其工资。这一规定明确了法定节假日是劳动者应有的休息时间，且在此期间，即便劳动者未进行实际工作，用人单位也应照常支付工资。
• 《中华人民共和国劳动法》第四十四条：若用人单位在法定节假日安排劳动者工作，则需按照不低于劳动者正常工作时间工资的百分之三百支付加班工资。此条款旨在保障劳动者的休息权益和文化生活需求，同时鼓励用人单位合理规划工作时间，防止过度加班现象的发生。

实际操作与维权途径

在实际操作中，若用人单位违反法律规定，在法定节假日扣除劳动者工资，劳动者有多种途径可以维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：作为首选方式，劳动者可与用人单位进行沟通，明确指出法律规定并要求纠正不当行为，确保工资得到足额支付。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，劳动者可向当地劳动监察大队提出投诉。劳动监察部门具备对用人单位违法行为进行查处的权力，并可责令其改正及补发工资。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，劳动者还可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或通过司法途径提起诉讼，要求用人单位不仅支付被扣工资，还可能获得相应的赔偿金。

特殊情况说明

需特别注意的是，在某些特殊情况下，如劳动者请事假恰好包含法定节假日，对于事假部分，用人单位可依法不支付工资；但法定节假日部分，用人单位仍应按规定支付工资。

总结与建议

综上所述，法定节假日休息扣工资是违法的，劳动者应充分了解并维护自己的合法权益。若遇到此类情况，建议劳动者首先与用人单位进行友好协商，若协商无果，则可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。同时，用人单位也应严格遵守劳动法律法规，切实保障劳动者的各项权益，避免因违法行为而引发不必要的法律纠纷。

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