节假日休息扣年假是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律法规层面

根据《职工带薪年休假条例》以及相关劳动法律法规的规定，职工依法享受的法定节假日、休息日等假期，是不计入年休假假期的。也就是说，节假日本身就是职工的法定休息时间，用人单位不能因为职工在节假日休息了，就额外扣除其应享受的年假天数。这是国家为了保障职工的休息权益而制定的明确规定，用人单位必须遵守。

实际操作层面

在实际工作中，有些用人单位可能会因为各种原因，如工作安排、人员调配等，试图通过扣除年假的方式来平衡工作与休息的关系。但这种做法是违法的，侵犯了职工的合法权益。如果用人单位存在这样的行为，职工有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的权益。

特殊情况说明

当然，也存在一些特殊情况。比如，如果职工与用人单位在劳动合同或者集体合同中有特别的约定，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方可以按照约定来执行。但这种情况相对较少，且必须建立在双方自愿、平等、协商一致的基础上。

法律建议

1. 保留证据：如果用人单位存在节假日休息扣年假的行为，职工应尽可能保留相关证据，如工资条、考勤记录、劳动合同等，以便在需要时证明自己的权益受到了侵犯。
2. 及时沟通：职工可以先与用人单位进行沟通，明确表达自己的诉求和依据，尝试通过协商解决问题。
3. 寻求法律帮助：如果沟通无果，职工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，甚至通过诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

总之，节假日休息扣年假是不合法的行为，职工应了解自己的权益，并在必要时采取措施来维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。