公司有权拒绝该员工回来上班。针对这个问题，我们可以从以下几个角度进行详细分析：

一、劳动合同的解除与恢复

1. 劳动合同的解除：员工通过微信提出离职，这一行为在法律上可能被视为提出了解除劳动合同的意向。然而，仅凭微信消息并不足以构成正式的、具有法律效力的离职通知，除非公司明确接受并以书面形式确认。若公司未正式接受离职，且员工未办理离职手续，则劳动合同在法律上可能仍被视为有效。

2. 劳动合同的恢复：一旦员工提出离职，且公司未明确表示反对或未采取正式措施解除劳动合同，员工随后反悔并希望恢复工作，这并不意味着劳动合同可以自动恢复。劳动合同的恢复需要双方协商一致，并可能涉及重新签订或修改劳动合同。

二、公司的权利与义务

1. 公司的拒绝权：在员工提出离职但未办理离职手续的情况下，公司有权根据自身的经营需要和员工的表现，决定是否接受员工回来上班。如果公司认为员工的离职行为已经对公司的运营造成了影响，或者认为员工不适合继续在公司工作，公司有权拒绝员工回来上班。

2. 公司的义务：虽然公司有权拒绝员工回来上班，但这一决定应当基于合理的理由，并遵循相关的法律法规。公司不能无故拒绝员工回来上班，否则可能面临法律纠纷。

三、法律后果与风险

1. 员工可能面临的后果：如果公司拒绝员工回来上班，员工可能需要寻找新的工作机会。同时，员工也可以考虑通过法律途径维护自己的权益，如提起劳动仲裁或诉讼，要求公司承担相应的法律责任。但这一过程可能耗时耗力，且结果不确定。

2. 公司可能面临的风险：如果公司无故拒绝员工回来上班，且无法提供合理的理由，员工可能会提起劳动仲裁或诉讼。在这种情况下，公司可能需要承担支付经济补偿金、赔偿金等法律责任。此外，公司的声誉和形象也可能受到损害。

四、建议与措施

1. 对于员工：在提出离职前，应当慎重考虑，并确保自己的决定是经过深思熟虑的。如果提出离职后反悔，应当尽快与公司沟通，并尝试协商解决方案。如果无法达成一致，可以考虑通过法律途径维护自己的权益。

2. 对于公司：在收到员工的离职通知后，应当及时与员工沟通，并明确公司的立场和决定。如果决定拒绝员工回来上班，应当提供合理的理由，并遵循相关的法律法规。同时，公司也可以考虑与员工协商解决方案，如支付一定的经济补偿等，以避免不必要的法律纠纷。

总结来看，公司有权拒绝超50岁且已通过微信提出离职但未办理离职手续的员工回来上班。但这一决定应当基于合理的理由，并遵循相关的法律法规。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。