针对单位未及时报送农民工工资资料的情况，若需开具罚款单，应依据相关法律法规，由具有行政处罚权的劳动保障监察部门或相关主管部门依法作出，具体流程及要点如下：

1. 法律依据与罚款主体
   根据《保障农民工工资支付条例》（国务院令第724号）第五十四条，“有下列情形之一的，由人力资源社会保障行政部门责令限期改正；逾期不改正的，对单位处5万元以上10万元以下的罚款，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处1万元以上3万元以下的罚款”，其中就包括“未按照规定编制工资支付台账并依法保存，或者未向农民工提供工资清单”。
   因此，罚款主体应为人力资源社会保障行政部门（即劳动保障监察部门），其他部门（如建设单位、行业主管部门）无权直接开具罚款单，但可依据行业规定或合同约定采取其他约束措施（如信用扣分、限制招投标等）。

2. 罚款单开具的法定程序

   • 调查取证：劳动保障监察部门需通过现场检查、询问当事人、查阅工资支付台账等方式，确认单位存在“未及时报送资料”的违法行为，并固定证据（如书面通知、送达回执、单位未报送的证明材料）。
     
   • 责令改正：先向单位下达《劳动保障监察限期改正指令书》，要求其在规定期限内补报资料（通常为5-10个工作日）。
     
   • 逾期不改正的处罚：若单位未在指定期限内改正，劳动保障监察部门应制作《行政处罚事先告知书》，告知单位拟处罚的事实、依据、金额及陈述申辩权利。
     
   • 听证与决定：单位要求听证的，应组织听证；听证结束后或单位放弃权利的，制作《行政处罚决定书》，明确罚款金额、缴纳方式及期限（通常为15日内）。
     
   • 送达与执行：将处罚决定书依法送达单位，逾期不缴纳罚款的，可申请法院强制执行，并每日按罚款数额的3%加处罚款。

3. 罚款金额的确定
   根据《保障农民工工资支付条例》第五十四条，对单位的罚款幅度为5万元至10万元，具体金额需结合违法情节（如未报送资料的持续时间、涉及农民工人数、是否造成欠薪后果等）综合判定。例如：

   • 首次违法且未造成严重后果的，可处5万元罚款；
     
   • 多次违法或导致农民工集体讨薪的，可处10万元罚款。
     同时，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处1万元至3万元罚款，需在处罚决定中明确个人责任。

4. 注意事项

   • 主体资格：非劳动保障监察部门（如建设单位、总包单位）无权直接罚款，但可依据《保障农民工工资支付条例》第三十二条要求分包单位配合报送资料，逾期可按合同约定扣除工程款或采取其他措施。
     
   • 程序合法性：罚款必须遵循“调查-责令改正-告知-听证（可选）-决定-送达-执行”的法定程序，否则可能因程序违法被撤销。
     
   • 证据充分性：需证明单位“未及时报送”是主观故意或重大过失，而非客观不可抗力（如系统故障需提供证明）。

建议：若您是劳动保障监察部门工作人员，需严格按上述程序操作；若您是单位相关人员，收到限期改正指令后应立即补报资料，避免罚款；若对处罚有异议，可在收到决定书后60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。