劳动合同中约定自动离职条款的合法性取决于具体情况及是否履行了法定程序。以下是对此问题的详细分析：
一、合法的情况
用人单位存在过错：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条，若用人单位存在以下情形，劳动者可以即时解除劳动合同并自动离职，且无需承担法律责任：
- 未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件；
- 未及时足额支付劳动报酬；
- 未依法为劳动者缴纳社会保险费；
- 用人单位的规章制度违反法律、法规的规定，损害劳动者权益；
- 因其他法定情形致使劳动合同无效。
- 在这些情况下，即使劳动合同中有自动离职的约定，劳动者也有权立即解除合同。
提前通知用人单位：
- 劳动者在提前履行了法定通知义务的情况下，可以合法自动离职。具体来说：
- 一般情况下，劳动者需提前三十日以书面形式通知用人单位；
- 在试用期内，劳动者需提前三日通知用人单位。
- 只要按照上述规定的时间和要求通知了用人单位，劳动者的自动离职行为即符合法律规定。
二、不合法的情况
未履行法定程序：
- 若用人单位不存在过错，且劳动者未提前按规定时间书面通知用人单位或未与用人单位协商一致，就擅自自动离职，这种行为是不合法的。它可能给用人单位的正常生产经营带来不利影响，如工作交接中断、项目延误等。在此情况下，用人单位有权按旷工处理，甚至解除劳动合同，且可能不给予经济补偿。
违反服务期约定：
- 如果用人单位为劳动者提供了专项培训费用并进行专业技术培训，且与劳动者约定了服务期，那么劳动者在服务期内自动离职将违反约定，需按照约定向用人单位支付违约金。
违反竞业限制约定：
- 对于负有保密义务的劳动者，如果用人单位在劳动合同或保密协议中与其约定了竞业限制条款，并在解除或终止劳动合同后按月给予经济补偿，那么劳动者在竞业限制期限内自动离职到与原单位有竞争关系的单位工作，这种行为也是不合法的，需向用人单位支付违约金。
三、建议与总结
- 对于劳动者：在离职前，应仔细了解相关法律法规和公司规定，确保自己的离职行为合法合规。如果劳动合同中有自动离职的约定，应评估该约定是否违反了法律法规的强制性规定，以及是否在自己有权解除合同的情形下适用。同时，按照规定的程序和时间要求办理离职手续，以避免不必要的法律纠纷和经济损失。
- 对于用人单位：应加强劳动合同管理，确保合同条款合法合规，不侵犯劳动者的合法权益。在制定规章制度时，应遵循法律法规的规定，不得损害劳动者的权益。同时，在劳动者离职时，应按照法律法规和公司规定办理离职手续，确保自身合法权益不受侵害。
总之，劳动合同中约定自动离职条款的合法性并非绝对，而是取决于具体情况及是否履行了法定程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。