针对您提出的“公司罚款不合理，离职是否可以申请补偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，企业无权对员工进行经济处罚。根据国家相关法律规定，具有实施经济处罚权力的仅限于特定的法定机关，而企业并不具备此项权利。因此，若您在公司遭受了不合理的罚款，这实际上是一种变相的薪酬扣减行为。

在这种情况下，您有权向当地的劳动监察及劳动管理部门进行投诉。相应部门会依法要求企业如期全额发放您应有的薪资待遇，并且，如果罚款行为被认定为不合理或违法，您还有权要求企业支付经济补偿或赔偿金。

关于离职与补偿的关系，需要明确的是，您是否选择离职与能否获得补偿并不存在必然联系。即使您选择继续留在公司工作，如果公司的不合理罚款行为得到了证实，您依然有权要求公司进行补偿。反之，如果您因为公司的不合理罚款而选择离职，您同样有权要求公司支付相应的经济补偿。

经济补偿的具体标准，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，是按照您在本单位工作的年限来计算的。每满一年，公司需要支付一个月工资的标准向您支付经济补偿；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则向您支付半个月工资的经济补偿。

最后，如果公司拒绝支付您应得的经济补偿，您可以通过劳动仲裁等合法途径来维护自身的权益。劳动仲裁是一种有效、公正的解决劳动争议的方式，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，如果公司对您进行了不合理的罚款，您有权要求公司进行补偿，并且这种补偿请求与您是否选择离职无关。希望以上解答能够对您有所帮助。