解除劳动合同协议中约定员工保密协议违约金，在符合一定条件下是合法的，但并非所有情况都合法有效。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法有效的情形
竞业限制条款中的违约金
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同或保密协议中约定竞业限制条款。这些条款通常包括在劳动合同解除或终止后的一段时间内（一般不超过二年），劳动者不得从事与原用人单位存在竞争关系的工作或活动。
- 作为补偿，用人单位需按月向劳动者支付一定的经济补偿金。若劳动者违反了竞业限制约定，则需按照事先的约定向用人单位支付违约金。这种情况下，保密协议中的违约金约定是合法有效的。
双方真实意愿且内容合法的单纯保密义务违约金
- 即便没有竞业限制条款，仅就保密义务本身而言，如果保密协议是双方真实意愿的表达，内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么约定违反保密义务时需支付的违约金，在司法实践中通常也会被认定为有效。
- 例如，劳动者在工作期间或离职后泄露了公司的商业秘密，给公司造成了损失，且保密协议中明确约定了违约金条款，那么劳动者可能需要按照约定支付违约金。
二、可能无效的情形
违反法律法规强制性规定的违约金
- 根据《劳动合同法》第二十五条的规定，除了违反服务期约定、违反竞业限制这两种情形可以约定由劳动者承担违约金外，其他情形用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
- 因此，如果保密协议中约定的违约金违反了这一强制性规定，那么相关约定可能会被认定为无效。例如，用人单位在保密协议中约定了劳动者在正常工作期间不得离职，否则需支付高额违约金，这种约定就可能因违反法律法规而无效。
违约金数额过高的情形
- 即便保密协议中的违约金约定在形式上合法，但如果违约金数额过高，显失公平，那么也可能被法院或仲裁机构调整或认定为无效。
- 例如，劳动者因疏忽大意泄露了少量非核心商业秘密，但保密协议中约定的违约金数额却远高于实际损失，这种情况下，劳动者可以请求法院或仲裁机构对违约金数额进行调整。
三、法律建议
对于用人单位
- 在制定保密协议时，应明确保密义务的具体内容、范围、期限等，并合理设定违约金数额。
- 同时，应确保保密协议中的条款不违反法律法规的强制性规定，不显失公平。
- 在劳动者违反保密义务时，应及时收集证据，并通过合法途径维护自身权益。
对于劳动者
- 在签署保密协议时，应仔细阅读合同条款，了解自己的权利与义务。
- 如果对保密协议中的违约金条款有异议，应及时与用人单位沟通协商。
- 在履行保密义务过程中，应严格遵守协议约定，避免泄露公司商业秘密。
总结：解除劳动合同协议中约定员工保密协议违约金，在符合竞业限制条款或双方真实意愿且内容合法的条件下是合法的。但用人单位应确保违约金数额合理，不违反法律法规的强制性规定；劳动者也应仔细阅读合同条款，了解自己的权利与义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。