检察院在特定情况下可以对包工头冒用农民工名义申请仲裁的案件进行监督。以下是对此问题的详细分析：

一、检察院的监督权基础

检察院作为法律监督机关，依据《中华人民共和国人民检察院组织法》等相关法律规定，有权对仲裁活动进行监督。这种监督旨在确保仲裁的公正性和合法性，维护当事人的合法权益，以及保障仲裁活动的正常秩序。

二、监督的具体情形

当仲裁存在违法情形时，检察院可以依据法律程序启动监督程序。这些违法情形包括但不限于：

1. 仲裁程序违反法定程序：如仲裁庭的组成、仲裁的管辖、仲裁的审理期限等违反法律规定。
2. 仲裁裁决依据的证据虚假：如包工头冒用农民工名义申请仲裁，并提供了虚假的证据材料。
3. 其他违法行为：如仲裁员在仲裁过程中有贪污受贿、徇私舞弊、枉法裁决等行为。

三、监督的方式和效果

检察院在发现仲裁存在上述违法情形时，可以采取多种方式进行监督，包括但不限于：

1. 提出检察建议：向仲裁机构提出检察建议，要求其纠正违法行为。
2. 提出抗诉：在符合法定条件的情况下，向人民法院提出抗诉，要求人民法院撤销或变更仲裁裁决。

通过这些监督方式，检察院可以有效地维护仲裁的公正性和合法性，保护当事人的合法权益。

四、针对包工头冒用农民工名义申请仲裁的具体分析

在包工头冒用农民工名义申请仲裁的情况下，如果仲裁机构未能发现这一违法行为，并作出了错误的仲裁裁决，那么检察院在发现后有权进行监督。检察院可以要求仲裁机构纠正违法行为，或者在必要时向人民法院提出抗诉，以撤销或变更错误的仲裁裁决。

五、建议与行动

如果您作为农民工或相关利益方，发现包工头存在冒用名义申请仲裁的行为，并怀疑仲裁裁决存在违法情形，您可以：

1. 收集证据：收集能够证明包工头冒用名义申请仲裁的证据材料，如身份证明、授权委托书、仲裁申请书等。
2. 向检察院申请监督：将收集到的证据材料提交给检察院，申请其对仲裁案件进行监督。
3. 寻求法律援助：如果您在法律程序上遇到困难或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我提问。