针对单位在编人员长期不上班的问题，这是一个需要细致、公正且依法处理的情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确问题性质与责任归属
首先，单位需要详细核实该员工的在编不在岗情况，包括其缺勤的具体时间、原因以及是否经过了相关领导的批准。这一步是后续处理措施的基础，有助于我们明确问题的性质和责任归属。
二、依法依规处理
根据员工的单位性质（行政机关或事业单位），我们可以采取不同的处理措施：
行政机关：
- 批评教育与责令改正：对于在编不在岗的公务员，单位应首先进行批评教育，并责令其限期返回工作岗位。
- 组织处理：如果员工拒不改正，单位可以考虑停发其工资、进行转岗或降职处理。若员工连续旷工超过规定天数（如15天），或一年内累计旷工超过30天，单位有权予以辞退。
- 纪律处分：根据情节的轻重，单位还可以给予员工警告、记过、记大过、降级、撤职乃至开除的处分。
事业单位：
- 调查核实与谈话：发现工作人员在编不在岗后，单位应展开调查并与当事人进行谈话，了解其离岗的具体原因。
- 相应处分：如果员工无正当理由离岗连续超过15个工作日，或一年内累计超过30个工作日，单位可以给予其警告、记过处分；情节较重的，可以降低其岗位等级或撤职；情节严重的，可以开除。
- 解除聘用合同：对于连续旷工超过15个工作日，或一年内累计旷工超过30个工作日的员工，单位有权解除其聘用合同。
三、经济问题与法律责任
- 如果员工在长期不上班期间违规领取了工资福利等经济待遇，相关部门有权责令其退还违规所得。
- 如果在编不在岗行为涉嫌违法犯罪，如骗取工资待遇，单位应依法向有关部门报案，追究其刑事责任。
四、协商解决与人文关怀
- 协商解决：对于因个人原因（如家庭困难、健康问题等）长期请假的员工，单位应尝试与其进行协商，了解其具体困难并探讨解决方案，鼓励其返岗或提供必要的支持。
- 人文关怀：单位应关注员工的身心健康和工作状态，对于确有困难的员工，应提供必要的帮助和关怀，以维护单位的和谐稳定。
五、完善管理制度
- 单位应反思并完善其考勤制度、请假审批流程等相关管理制度，确保员工在岗工作的规范性和有效性，防止类似情况再次发生。
六、综合考虑法律后果
- 在处理过程中，单位应充分考虑法律后果，确保所有处理措施均符合法律法规的要求。如有需要，单位可以咨询专业律师的意见，以避免法律风险。
综上所述，处理单位在编人员长期不上班的问题需要依法依规、公平公正地进行，同时注重人文关怀和制度建设。通过明确问题性质、依法处理、协商解决、完善制度和考虑法律后果等多方面的努力，我们可以确保单位的正常运转和员工的合法权益。