当公司给员工缴纳的社保基数低于员工实际工资时，如果员工选择起诉，公司可能会面临一系列不利影响。以下是对此问题的详细分析：

一、法律责任与赔偿

1. 工伤待遇差额赔偿：

   • 根据相关法律法规，如果公司未按照员工实际工资标准缴纳社保，导致员工在发生工伤时，工伤保险待遇降低（如一次性伤残补助金等），员工有权要求公司赔偿差额部分。
   • 例如，在您提供的案例中，冯某因工伤产生的医疗费、一次性伤残补助金差额等，均因公司未足额缴纳社保而需由公司承担。法院最终判决公司支付冯某一次性伤残补助金差额94842元。

2. 其他经济损失赔偿：

   • 除了工伤待遇差额外，如果公司未足额缴纳社保导致员工在其他方面（如医疗保险报销、生育保险待遇等）遭受经济损失，员工同样有权要求公司赔偿。

二、行政处罚与信誉损失

1. 行政处罚：

   • 社保部门有权对公司未足额缴纳社保的行为进行查处，并可能对公司处以罚款、滞纳金等行政处罚。
   • 这些处罚不仅会增加公司的经济负担，还可能影响公司的正常运营。

2. 信誉损失：

   • 公司未足额缴纳社保的行为可能损害其社会形象和信誉度，影响公司与员工、客户、合作伙伴等的关系。
   • 在竞争激烈的市场环境中，信誉损失可能导致公司失去业务机会、客户流失等严重后果。

三、诉讼成本与时间消耗

1. 诉讼成本：

   • 如果员工选择起诉公司，公司需要承担诉讼费用、律师费用等诉讼成本。
   • 这些成本可能因案件复杂程度、诉讼周期等因素而大幅增加。

2. 时间消耗：

   • 诉讼过程可能耗时较长，从起诉到判决可能需要数月甚至数年时间。
   • 在这段时间内，公司需要投入大量的人力和物力来应对诉讼，可能影响公司的正常运营和发展。

四、建议与预防措施

1. 合规缴纳社保：

   • 公司应严格按照相关法律法规和政策要求，为员工足额缴纳社保。
   • 这不仅可以避免法律风险和行政处罚，还可以提升公司的社会形象和信誉度。

2. 加强内部管理：

   • 公司应建立健全的社保缴纳管理制度，确保社保缴纳的准确性和及时性。
   • 同时，公司应加强对员工的宣传和教育，提高员工对社保政策的认知度和满意度。

3. 积极应对诉讼：

   • 如果公司面临员工起诉的情况，应积极应对诉讼，配合法院的调查和审理工作。
   • 同时，公司可以寻求专业律师的帮助，制定合理的诉讼策略和辩护方案。

综上所述，公司给员工缴纳社保基数低于实际工资时，如果员工起诉，公司可能会面临法律责任与赔偿、行政处罚与信誉损失、诉讼成本与时间消耗等不利影响。因此，公司应严格遵守相关法律法规和政策要求，为员工足额缴纳社保，以维护公司的合法权益和良好形象。