若员工不承认劳动合同上的字是自己签的，可按以下步骤处理：

一、申请笔迹鉴定

1. 目的：通过专业机构对劳动合同上的签字进行笔迹鉴定，以确定签字是否为员工本人所签。
2. 流程：
   • 选择具有资质的笔迹鉴定机构。
   • 提交劳动合同原件及员工的其他签字样本（如入职登记表、工资单等）作为比对材料。
   • 等待鉴定机构出具鉴定报告。
3. 结果处理：
   • 若鉴定报告显示签字为员工本人所签，则劳动合同的签字环节无瑕疵，合同有效。
   • 若鉴定报告显示签字非员工本人所签，则劳动合同在签字环节存在瑕疵，需进一步收集证据证明合同关系的存在及履行情况。

二、收集其他相关证据

1. 证据类型：
   • 聊天记录：员工与用人单位之间关于工作安排、工资发放等内容的聊天记录。
   • 邮件往来：员工与用人单位之间关于工作事项的邮件沟通记录。
   • 交付凭证：员工领取工资、工作用品等交付凭证。
   • 证人证言：其他员工或知情人的证言，证明员工与用人单位之间存在劳动关系。
2. 证据链形成：将上述证据与劳动合同（即使签字存在争议）相结合，形成完整的证据链，以证明员工与用人单位之间存在真实的劳动关系及合同履行情况。

三、根据实际情况认定合同效力

1. 若一方无正当理由不承认签字，但实际履行了合同主要义务：
   • 情形：员工虽不承认签字，但实际在用人单位工作，并接受了用人单位支付的工资等福利待遇。
   • 认定：在此情况下，可认定劳动合同成立并生效。因为实际履行行为已经表明双方对合同内容达成了合意。
2. 若无法形成完整证据链，且一方坚决否认签字：
   • 情形：员工不承认签字，且用人单位无法提供其他充分证据证明劳动合同关系的存在及履行情况。
   • 处理：在此情况下，劳动合同的效力可能受到质疑。用人单位可能需要承担举证不能的责任，即无法证明与员工之间存在劳动关系。

四、法律建议与风险提示

1. 及时固定证据：在发现员工不承认签字后，用人单位应立即采取措施固定相关证据，如申请笔迹鉴定、收集聊天记录等，以避免证据灭失或难以收集。
2. 合法合规处理：用人单位在处理此类纠纷时，应遵守相关法律法规，不得采取威胁、恐吓等非法手段迫使员工承认签字。
3. 寻求法律帮助：若纠纷复杂或难以处理，用人单位可及时咨询专业律师，以获取更全面的法律建议和帮助。

总结来说，面对员工不承认劳动合同签字的情况，用人单位应首先申请笔迹鉴定，然后收集其他相关证据形成证据链，最后根据实际情况认定合同效力。在整个过程中，用人单位应遵守法律法规，及时固定证据，并可在必要时寻求专业律师的帮助。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。