申请劳动仲裁主张一次性伤残补助金，并不会自动导致劳动关系终止。下面我从几个方面详细解释这个问题：
一、劳动关系终止的法定条件
劳动关系的终止，通常需要满足法定的条件，比如劳动合同期满、双方协商一致解除、劳动者或用人单位单方解除等。仅仅因为劳动者申请了劳动仲裁，主张一次性伤残补助金，并不构成劳动关系终止的法定理由。
二、一次性伤残补助金的性质与主张时机
一次性伤残补助金是工伤保险待遇的一部分，用于补偿劳动者因工伤造成的伤残损失。根据相关规定，一次性伤残补助金不同于一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金，不需要以解除劳动关系为前提条件。在劳动能力等级鉴定结论作出后，劳动者就可以主张一次性伤残补助金。
三、申请劳动仲裁对劳动关系的影响
申请劳动仲裁是劳动者维护自身合法权益的一种方式。在这个过程中，劳动者主张的是一次性伤残补助金等工伤保险待遇，而不是要求解除劳动关系。因此，申请劳动仲裁本身并不会对劳动关系产生直接的影响，更不会导致劳动关系的自动终止。
四、实际操作中的建议
及时主张权利：劳动者应在收到劳动能力等级鉴定结论之日起一年内，及时通过法律途径主张一次性伤残补助金，避免因超过时效而丧失胜诉权。
保留证据：在申请劳动仲裁前，劳动者应收集并保留好与工伤相关的证据，如工伤认定书、劳动能力鉴定结论、医疗费用票据等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。
咨询专业律师：如果劳动者在申请劳动仲裁或主张一次性伤残补助金过程中遇到法律问题，可以向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。
五、法律后果
如果劳动者未在法定期限内主张一次性伤残补助金，可能会因超过时效而丧失胜诉权。但这与劳动关系的终止无关，只是劳动者可能无法获得相应的工伤保险待遇。
总结来说，申请劳动仲裁主张一次性伤残补助金并不会自动导致劳动关系的终止。劳动者应在法定期限内及时主张自己的权利，并保留好相关证据。如果遇到法律问题，可以直接向我咨询。