若主管部门评标专家在评审过程中应当回避而未回避，其处理方式需根据不同阶段和具体情况来确定，具体如下：

1. 评标过程中被发现：

   • 法律依据：根据《政府采购货物和服务招标投标管理办法》(财政部令第87号)第四十九条的规定，若政府采购评审专家与供应商存在利害关系应主动回避而未回避，导致评标委员会组成不符合规定的，采购人或者采购代理机构应当依法补足后继续评标。
   • 处理方式：在此阶段，一旦发现评标专家应当回避而未回避，应立即停止其评标工作，并依法补足评标委员会成员，以确保评标过程的合法性和公正性。

2. 评标报告已签署或已发中标公告后才发现：

   • 法律依据：根据《政府采购货物和服务招标投标管理办法》(财政部令第87号)第六十七条的规定，若评标报告已签署或已发中标公告后才发现应回避而未回避的情况，原评标报告作无效处理。采购人、采购代理机构需书面报告本级财政部门，从政府采购专家库中重新抽取评标专家，重新组建评标委员会进行重新评审、重新编制评标报告、重新发布中标公告。
   • 处理方式：在此阶段，由于评标结果已经产生甚至已经公告，因此需要采取更为严格的措施。原评标报告将被视为无效，采购人或采购代理机构需向财政部门报告，并重新抽取专家进行评审，以确保评标结果的合法性和公正性。

3. 对评标专家个人的处罚：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》第七十一条的规定，评标委员会成员有应当回避而不回避等行为的，由有关行政监督部门责令改正；情节严重的，禁止其在一定期限内参加依法必须进行招标的项目的评标；情节特别严重的，取消其担任评标委员会成员的资格。同时，根据《政府采购法实施条例》第七十五条的规定，政府采购评审专家与供应商存在利害关系应回避而未回避的，其评审意见无效，不得获取评审费；处2万元以上5万元以下的罚款，禁止其参加政府采购评审活动。有违法所得的，没收违法所得；给他人造成损失的，依法承担民事责任。
   • 处理方式：对于应当回避而不回避的评标专家，除了上述针对评标过程的处理措施外，还将对其个人进行处罚。处罚措施包括责令改正、罚款、禁止参加评标活动、取消评标资格等，具体根据情节严重程度来决定。

建议：在实际操作中，为避免类似情况的发生，采购人或采购代理机构应在评标前对评标专家的资格进行严格审查，确保其与供应商无利害关系。同时，评标专家也应自觉遵守回避制度，确保评标过程的公正性和合法性。若您在此过程中遇到任何法律问题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。