结论：原工医疗期满后，医生建议继续治疗而单位不批准假并按旷工处理，这一做法是否合法需分情况讨论，一般情况下不合法，但存在特殊情形可能被认定为合法。以下从不同角度进行分析：
一、一般情况下，单位不批准假并按旷工处理不合法
医疗期规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据职工本人实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，一般为三个月到二十四个月不等。
- 在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同，且应按照规定支付病假工资或疾病救济费。
医生建议继续治疗的法律效力：
- 医生作为专业医疗人员，其出具的建议具有专业性和权威性。若医生建议职工继续治疗，且该建议基于合理的医疗判断，那么职工有权继续享受医疗期内的相关待遇。
- 用人单位应尊重医生的建议，不得擅自剥夺职工继续治疗的权利。
单位不批准假并按旷工处理的违法性：
- 若职工在医疗期满后，因病情需要继续治疗，且医生出具了相应的建议，而用人单位不批准假并按旷工处理，这一做法违反了医疗期的相关规定，也侵犯了职工的合法权益。
- 职工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位撤销旷工处理决定，并支付相应的病假工资或疾病救济费。
二、特殊情形下，单位不批准假并按旷工处理可能被认定为合法
职工病情已稳定，无需继续治疗：
- 若职工在医疗期满后，病情已稳定，无需继续治疗，而职工仍以需要治疗为由要求继续休假，用人单位有权不批准假。
- 在此情况下，若职工未经批准擅自离岗，用人单位可以按旷工处理。
职工未提供有效医疗证明：
- 若职工在医疗期满后，声称需要继续治疗，但未能提供医生出具的有效医疗证明，用人单位有权要求职工提供证明或不予批准假。
- 若职工无法提供证明且未经批准擅自离岗，用人单位可以按旷工处理。
用人单位已提供合理调整工作岗位或安排其他工作：
- 若职工在医疗期满后，因身体原因无法从事原工作，但用人单位已根据其身体状况提供了合理的工作岗位调整或安排了其他适合的工作，而职工拒绝接受，用人单位可以按旷工处理。
三、法律建议
对于职工：
- 在医疗期满后，若需要继续治疗，应及时向用人单位提供医生出具的有效医疗证明，并按照用人单位的规定办理请假手续。
- 若用人单位不批准假或按旷工处理，可以与用人单位协商解决，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
对于用人单位：
- 应尊重医生的建议，不得擅自剥夺职工继续治疗的权利。
- 若职工在医疗期满后无需继续治疗或未提供有效医疗证明，用人单位可以按照规定处理，但应确保处理程序的合法性和合理性。
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