员工在医疗期内因坐牢被解除劳动关系，一般情况下没有赔偿，但若用人单位解除程序违法，则员工有权主张赔偿金、病假工资及医疗补助费。具体分析如下：
一、医疗期内解除劳动关系的合法性
根据《劳动合同法》及相关规定，员工在医疗期内享有特殊的劳动保护，用人单位不得随意解除劳动合同。然而，若员工因犯罪被依法追究刑事责任（如坐牢），则属于《劳动合同法》第三十九条规定的用人单位可以解除劳动合同的法定情形之一。在此情况下，若用人单位依法解除劳动合同，则无需支付赔偿金。
二、用人单位违法解除劳动关系的后果
尽管员工因犯罪被追究刑事责任属于用人单位可以解除劳动合同的法定情形，但若用人单位在解除程序上存在违法（如未提前通知工会、未依法送达解除通知等），则可能构成违法解除。在此情况下，员工有权主张赔偿金、病假工资及医疗补助费。
赔偿金：根据《劳动合同法》第四十八条、第八十七条，用人单位违法解除劳动合同的，应当按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿标准根据劳动者在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资。
病假工资：病假工资属于劳动者保护性给付。即使用人单位支付了违法解除劳动关系的赔偿金，若员工在医疗期内，用人单位仍应支付病假工资。这是因为病假工资是劳动者应当获得的工资待遇，用人单位在医疗期内有义务向劳动者支付。
医疗补助费：医疗补助费是为保障劳动者继续治疗疾病而赋予单位的一项社会责任和法定责任。在用人单位违法解除劳动关系的情况下，员工有权主张医疗补助费。赔偿金与医疗补助费的性质和功能不同，现有法律规定亦未明确赔偿金可覆盖医疗补助费。
三、具体案例与司法实践
以杨某诉某科技公司劳动争议纠纷案为例，杨某在医疗期内因膝盖疾病导致下肢瘫痪，向公司请假治疗。后公司以杨某“自离”为由解除劳动关系。杨某诉至法院，请求公司支付违法解除劳动关系赔偿金、病假工资及医疗补助费等。法院最终判决公司支付杨某违法解除劳动关系赔偿金、病假工资及医疗补助费。该案例表明，即使员工因犯罪被追究刑事责任属于用人单位可以解除劳动合同的法定情形，但若用人单位在解除程序上存在违法，则仍需承担相应的法律责任。
四、建议与注意事项
用人单位：在解除与员工的劳动合同时，务必确保解除程序合法合规，避免因程序违法而承担不必要的法律责任。
员工：若认为用人单位解除劳动合同的行为违法，可及时向劳动争议仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
证据收集：无论是用人单位还是员工，在处理劳动争议时，都应注重证据的收集与保存，以便在争议解决过程中提供有力的支持。
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