结论：上班第二天因医生开具的请假条请假两天后被辞退，这一行为是否合法取决于多个因素，但通常情况下，用人单位仅因员工短期请假就辞退员工是不合法的。
详细分析：
医疗期的法律规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。虽然您仅上班第二天，但医疗期的规定并不完全依赖于工作年限的长短，而是基于员工确实需要医疗的事实。
- 医生开具的请假条是证明您需要医疗休息的有效证据，用人单位应予以尊重。
用人单位辞退的合法性：
- 用人单位辞退员工必须基于合法的理由，如员工严重违反公司规章制度、不能胜任工作且经过培训或调岗后仍不能胜任、客观情况发生重大变化导致合同无法履行等。
- 仅因员工短期请假就辞退，通常不被视为合法理由。除非请假行为违反了公司明确的规章制度（如未经批准擅自离岗），但这种情况较为罕见，且规章制度本身需合法合理。
可能的法律后果：
- 如果用人单位无正当理由辞退您，您有权要求用人单位继续履行合同或支付赔偿金。赔偿金通常根据您的工作年限和工资水平来计算，虽然您工作年限短，但仍有权获得相应的赔偿。
- 您还可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议与行动：
- 首先，与用人单位沟通，了解辞退的具体原因，并要求其提供书面辞退通知。
- 如果沟通无果，收集相关证据（如请假条、工作记录、辞退通知等），向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在整个过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的权益。
特殊情况说明：
- 如果您的请假行为确实违反了公司明确的规章制度，且该规章制度经过合法程序制定并公示，那么用人单位的辞退行为可能具有一定的合法性。但即便如此，用人单位也应给予您合理的解释和申诉机会。
总结与建议：
- 通常情况下，用人单位仅因员工短期请假就辞退员工是不合法的。您有权依法维护自己的权益，包括要求继续履行合同或获得赔偿金。
- 在处理此类纠纷时，建议保持冷静和理性，依法收集证据并寻求专业帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。